Nup88 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-404091

Übersicht

NUP88 kodiert Nup88, eine zentrale Komponente des Kernporenkomplexes, die zum nukleozytoplasmatischen Transport und zur Organisation der zytoplasmatischen Seite der Kernporen beiträgt. Nup88 ist an der Regulation des Protein- und RNA-Transports beteiligt, beeinflusst den Verlauf des Zellzyklus und greift in Signalwege ein, die die Genexpression steuern – unter anderem über die transportabhängige Lokalisation von Transkriptionsregulatoren. Eine dysregulierte NUP88-Expression oder veränderte Dynamiken des nukleären Transports wurden mit Tumorbiologie und aberranter Signalübertragung in Verbindung gebracht, was NUP88 für Studien zu Proliferation, Stressantworten und Genomstabilität relevant macht. In menschlichen Zellen bietet eine Störung von Nup88 einen direkten Ansatzpunkt, um zu untersuchen, wie die Zusammensetzung der Kernpore die Transportselektivität und nachgeschaltete Transkriptionsprogramme prägt.

Das Nup88 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des NUP88-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des NUP88-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von NUP88 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die Nup88-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von NUP88-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der Nup88-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf NUP88-Exone abzielen, die für die Nup88-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere NUP88-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom Nup88 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom Nup88 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des NUP88-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das Nup88 HDR-Plasmid (h) und Nup88 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von NUP88-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten NUP88-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.