MMP-21 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-414131

Panoramica

MMP21 codifica la metalloproteinasi della matrice 21 (MMP-21), un’endopeptidasi secreta e zinco-dipendente che contribuisce al rimodellamento della matrice extracellulare scindendo substrati della matrice e della superficie cellulare. Come parte della rete proteolitica delle MMP, MMP-21 influenza la proteolisi pericellulare, la dinamica della membrana basale e la segnalazione cellula–matrice che modellano le interazioni epitelio–mesenchimali. Queste attività si intersecano con vie collegate ai programmi di migrazione e invasione, tra cui l’adesione mediata da integrine, la biodisponibilità dei fattori di crescita e il rimodellamento tissutale infiammatorio. Un’alterata espressione di MMP21 è stata riportata in molteplici contesti patologici in cui un turnover anomalo della matrice accompagna la progressione della malattia, a supporto del suo valore come nodo meccanicistico nella biologia della matrice.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO MMP-21 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene MMP21 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del MMP21 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto MMP21 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina MMP-21.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di MMP21 per lo studio della segnalazione di MMP-21, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni MMP21 critici per la funzione di MMP-21
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di MMP21 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal MMP-21 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal MMP-21 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus MMP21. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal MMP-21 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR MMP-21 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia MMP21 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio MMP21 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.