karyopherin 13 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-404551

Übersicht

IPO13 kodiert Karyopherin 13 (Importin-13), einen bidirektionalen Rezeptor für den nukleären Transport, der den RanGTP-abhängigen Shuttling-Transport bestimmter Proteincargos durch den Kernporenkomplex vermittelt. Durch die Kontrolle der Dynamik von nukleärem Import und Export beeinflusst IPO13 Transkriptionsprogramme, den Zellzyklusverlauf und stressresponsive Signalwege, indem es die Lokalisation und Verfügbarkeit seiner Cargos reguliert. Ein veränderter nukleozytoplasmatischer Transport ist ein wiederkehrendes Merkmal oncogener Transformation und neurodegenerativer Phänotypen, wodurch IPO13 ein relevanter Knotenpunkt ist, um zu untersuchen, wie Transporttreue die Genomregulation und Proteostase prägt. Die Funktion von IPO13 ist zudem für Wirt–Pathogen-Interaktionen und die angeborene Immun-Signalgebung bedeutsam, bei denen der nukleäre Zugang regulatorischer Faktoren geschwindigkeitsbestimmend sein kann.

Das karyopherin 13 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des IPO13-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des IPO13-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von IPO13 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die karyopherin 13-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von IPO13-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der karyopherin 13-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf IPO13-Exone abzielen, die für die karyopherin 13-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere IPO13-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom karyopherin 13 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom karyopherin 13 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des IPO13-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das karyopherin 13 HDR-Plasmid (h) und karyopherin 13 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von IPO13-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten IPO13-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.