ITM1 Double Nickase Plasmid (m): sc-421187-NIC
- Zielspezies: mouse
- 20 µg transfektionsfertige, aufgereinigte Plasmid DNA; geeignet für 20 Transfektionen
- Das ITM1 Double Nickase Plasmid (m) wird als Plasmid-Paar geliefert. Die einzelnen Plasmide kodieren für eine D10A mutierte Cas9 Nuklease sowie für je eine unterschiedliche, zielspezifische 20nt guide RNA (gRNA) Sequenz. Dies erlaubt eine hohe Knockout-Effizienz bei gleichzeitig größerer Spezifität als das entsprechende CRISPR/Cas9 KO Plasmid
- gRNA Sequenzpaare liegen ca. 20 bp auseinander um ein spezifisches Cas9-vermitteltes "Double Nicking" der genomischen DNA zu erlauben und so im Resultat den Effekt eines Doppelstrangbruchs nachzuahmen.
- Ein Plasmid kodiert für ein Puromycin-Resistenzgen zur Selektion von stabilen Knockout-Zellen. Das andere Plasmid kodiert für ein GFP-Gen für den visuellen Nachweis der Transfektion
- ITM1 Double-Nickase-Plasmid (m) und ITM1 Double-Nickase-Plasmid (m2) kodieren unterschiedliche gepaarte gRNA-Designs, die auf Stt3a abzielen. Möglicherweise ist eines oder sind beide Designs verfügbar
- Nach der Transfektion kann die Effizienz des Gen-Knockouts per Western Blot oder histologisch mit folgendem Antikörper überprüft werden: ITM1: sc-390227
Bestellinformation
| Produkt | Katalog # | EINHEIT | Preis | ANZAHL | Favoriten | |
ITM1 Double Nickase Plasmid (m) | sc-421187-NIC | 20 µg | $410.00 | |||
ITM1 Double Nickase Plasmid (m2) | sc-421187-NIC-2 | 20 µg | $410.00 |
Mouse Stt3a kodiert eine katalytische Untereinheit des Oligosaccharyltransferase-(OST)-Komplexes, der im endoplasmatischen Retikulum die kotranslationale N‑verknüpfte Glykosylierung neu entstehender Polypeptide vermittelt. Durch die Übertragung vorassemblierter Oligosaccharide auf Asparaginreste innerhalb des Konsensusmotivs NXS/T unterstützt STT3A die Proteinfaltung, Qualitätskontrolle und den Transport und beeinflusst die ER‑Homöostase sowie Netzwerke der Proteostase. Eine Störung der STT3A‑abhängigen Glykosylierung kann die ER‑Stressantwort, die Leistungsfähigkeit des sekretorischen Weges und die Zusammensetzung von Zelloberflächen‑Glykoproteinen verändern – mit nachgelagerten Folgen für Signalübertragung und Immunerkennung. Fehlregulierte N‑Glykosylierung und OST‑Funktion sind für Studien zu angeborenen Glykosylierungsstörungen, metabolischem Stress und der krebsassoziierten Umgestaltung von Glykoproteomen breit relevant und unterstützen mechanistische Forschung in krankheitsbezogenen Signalwegen, ohne eine klinische Nutzbarkeit zu implizieren.
ITM1 Das Double-Nickase-Plasmid (m) besteht aus einem aufeinander abgestimmten Plasmidpaar, das für die hochspezifische Bearbeitung des Stt3a-Lokus in mouse-Zelllinien entwickelt wurde. Jedes Plasmid exprimiert eine Cas9-D10A-Nickase und eine spezifische sgRNA, die auf entgegengesetzte DNA-Stränge innerhalb von Stt3a abzielt. Wenn sie auf benachbarte Stellen auf entgegengesetzten DNA-Strängen gerichtet sind, erzeugen die beiden Nickasen versetzte Einzelstrang-Schnitte, die zusammen einen versetzten Doppelstrangbruch erzeugen, was eine koordinierte On-Target-Aktivität beider Guides erfordert. Der resultierende DNA-Bruch wird durch endogene zelluläre Reparaturwege behoben, meist durch nicht-homologe Endverknüpfung (NHEJ), was zu Insertionen oder Deletionen führt, die die Stt3a-Funktion stören. Durch die Notwendigkeit einer doppelten sgRNA-Bindung am Zielort erhöht der Doppel-Nick-Ansatz die Spezifität der Bearbeitung und bietet eine komplementäre CRISPR-Strategie für Anwendungen, bei denen eine zusätzliche Kontrolle über die Zielgenauigkeit gewünscht ist.
Um eine effiziente Identifizierung editierter Zellen zu unterstützen, kodiert ein Plasmid GFP zur fluoreszierenden Visualisierung transfizierter Populationen, während das Begleitplasmid ein Puromycin-Resistenzgen für die Antibiotika-Selektion trägt. Zusammen unterstützen diese Merkmale eine effiziente Anreicherung co-transfizierter Populationen und vereinfachen die Validierung von Klonen mit Stt3a-Störung.
Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.