IFN-α9 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-421045

概要

Ifna9 は、ウイルスや微生物由来の核酸を自然免疫が感知することで誘導される I 型インターフェロンサイトカインであるマウス・インターフェロン α9（IFN-α9）をコードします。IFN-α9 は IFNAR 受容体複合体を介してシグナルを伝達し、JAK1/TYK2 および下流の STAT1/STAT2-IRF9（ISGF3）を活性化することで、病原体の複製を制限し抗原提示を再構築するインターフェロン刺激遺伝子（ISG）の転写を促進します。この経路は樹状細胞の活性化、マクロファージの極性化、T 細胞および B 細胞応答を調節し、IFN-α9 を炎症制御と免疫恒常性に結び付けます。I 型インターフェロンシグナルの破綻は慢性炎症や自己免疫性の表現型に関与し、感染モデルにおける免疫病理にも寄与することから、Ifna9 はマウス系で機序研究を行ううえで有用な解析ノードとなります。

IFN-α9 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるIfna9遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、Ifna9内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、Ifna9のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、IFN-α9タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、IFN-α9シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、Ifna9欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• IFN-α9の機能に不可欠なIfna9エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、Ifna9ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• IFN-α9 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびIFN-α9 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、Ifna9遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  IFN-α9 HDRプラスミド（m）および IFN-α9 HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはIfna9ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のIfna9標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。