HoxD12 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-407472

Übersicht

HOXD12 kodiert den Homeobox-Transkriptionsfaktor HoxD12, ein Mitglied des HOXD-Clusters, der während der embryonalen Entwicklung zur Festlegung der Positionsidentität beiträgt und die Musterbildung der Gliedmaßen sowie des axialen Skeletts koordiniert. Als DNA-bindender Regulator ist HoxD12 in umfassendere HOX-Regulationsnetzwerke und eine Regulation auf Chromatinebene eingebunden, um gewebespezifische Transkriptionsprogramme zu formen, die Differenzierung und Morphogenese steuern. Eine fehlregulierte HOXD12-Expression oder Störungen der Regulation des HOX-Clusters wurden mit Entwicklungsanomalien in Verbindung gebracht und in Transkriptionssignaturen verschiedener Krebsarten berichtet, was seine Rolle bei der Kontrolle von Gen-Netzwerken für Zelllinie und Wachstum widerspiegelt. In adulten und krankheitsbezogenen Kontexten kann eine veränderte HOXD12-Aktivität Zellzustandsübergänge, Migrationsprogramme und die Reaktivierung entwicklungsbiologischer Signalwege beeinflussen.

Das HoxD12 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des HOXD12-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des HOXD12-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von HOXD12 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die HoxD12-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von HOXD12-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der HoxD12-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf HOXD12-Exone abzielen, die für die HoxD12-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere HOXD12-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom HoxD12 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom HoxD12 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des HOXD12-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das HoxD12 HDR-Plasmid (h) und HoxD12 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von HOXD12-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten HOXD12-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.