HoxC8 Double Nickase Plasmid (h): sc-405407-NIC
- Zielspezies: human
- 20 µg transfektionsfertige, aufgereinigte Plasmid DNA; geeignet für 20 Transfektionen
- Das HoxC8 Double Nickase Plasmid (h) wird als Plasmid-Paar geliefert. Die einzelnen Plasmide kodieren für eine D10A mutierte Cas9 Nuklease sowie für je eine unterschiedliche, zielspezifische 20nt guide RNA (gRNA) Sequenz. Dies erlaubt eine hohe Knockout-Effizienz bei gleichzeitig größerer Spezifität als das entsprechende CRISPR/Cas9 KO Plasmid
- gRNA Sequenzpaare liegen ca. 20 bp auseinander um ein spezifisches Cas9-vermitteltes "Double Nicking" der genomischen DNA zu erlauben und so im Resultat den Effekt eines Doppelstrangbruchs nachzuahmen.
- Ein Plasmid kodiert für ein Puromycin-Resistenzgen zur Selektion von stabilen Knockout-Zellen. Das andere Plasmid kodiert für ein GFP-Gen für den visuellen Nachweis der Transfektion
- HoxC8 Double-Nickase-Plasmid (h) und HoxC8 Double-Nickase-Plasmid (h2) kodieren unterschiedliche gepaarte gRNA-Designs, die auf HOXC8 abzielen. Möglicherweise ist eines oder sind beide Designs verfügbar
- Nach der Transfektion kann die Effizienz des Gen-Knockouts per Western Blot oder histologisch mit folgendem Antikörper überprüft werden: HoxC8: sc-517007
Bestellinformation
| Produkt | Katalog # | EINHEIT | Preis | ANZAHL | Favoriten | |
HoxC8 Double Nickase Plasmid (h) | sc-405407-NIC | 20 µg | $410.00 | |||
HoxC8 Double Nickase Plasmid (h2) | sc-405407-NIC-2 | 20 µg | $410.00 |
HOXC8 kodiert den Homeobox-Transkriptionsfaktor HoxC8, einen sequenzspezifischen DNA-bindenden Regulator, der während der Embryogenese zur Musterbildung entlang der anterior–posterioren Achse beiträgt und Differenzierungsprogramme in mesodermalen sowie aus der Neuralleiste abgeleiteten Geweben steuert. HoxC8 moduliert über HOX-Kofaktor-Interaktionen und chromatinabhängige Regulation Gen-Netzwerke, die Zellschicksalsentscheidungen, Morphogenese und gewebespezifische Transkriptionsprogramme kontrollieren. Eine fehlregulierte HOXC8-Expression wurde in mehreren Tumorarten beschrieben und ist mit veränderten proliferativen und migratorischen Zuständen sowie mit EMT-assoziierten (epithelial–mesenchymalen Transition) Transkriptionssignaturen verbunden, was HOXC8 zu einem nützlichen Knotenpunkt für die Untersuchung entwicklungsbedingter Reprogrammierung und onkogener Signalwege macht. Darüber hinaus überschneidet sich die HOXC8-Aktivität mit Signalwegen, die den Umbau der extrazellulären Matrix und die Linienspezifizierung steuern, und unterstützt damit mechanistische Studien in Entwicklungsbiologie, Krebsbiologie und Transkriptionsregulation.
HoxC8 Das Double-Nickase-Plasmid (h) besteht aus einem aufeinander abgestimmten Plasmidpaar, das für die hochspezifische Bearbeitung des HOXC8-Lokus in human-Zelllinien entwickelt wurde. Jedes Plasmid exprimiert eine Cas9-D10A-Nickase und eine spezifische sgRNA, die auf entgegengesetzte DNA-Stränge innerhalb von HOXC8 abzielt. Wenn sie auf benachbarte Stellen auf entgegengesetzten DNA-Strängen gerichtet sind, erzeugen die beiden Nickasen versetzte Einzelstrang-Schnitte, die zusammen einen versetzten Doppelstrangbruch erzeugen, was eine koordinierte On-Target-Aktivität beider Guides erfordert. Der resultierende DNA-Bruch wird durch endogene zelluläre Reparaturwege behoben, meist durch nicht-homologe Endverknüpfung (NHEJ), was zu Insertionen oder Deletionen führt, die die HOXC8-Funktion stören. Durch die Notwendigkeit einer doppelten sgRNA-Bindung am Zielort erhöht der Doppel-Nick-Ansatz die Spezifität der Bearbeitung und bietet eine komplementäre CRISPR-Strategie für Anwendungen, bei denen eine zusätzliche Kontrolle über die Zielgenauigkeit gewünscht ist.
Um eine effiziente Identifizierung editierter Zellen zu unterstützen, kodiert ein Plasmid GFP zur fluoreszierenden Visualisierung transfizierter Populationen, während das Begleitplasmid ein Puromycin-Resistenzgen für die Antibiotika-Selektion trägt. Zusammen unterstützen diese Merkmale eine effiziente Anreicherung co-transfizierter Populationen und vereinfachen die Validierung von Klonen mit HOXC8-Störung.
Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.