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HoxC6 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-403393-ACT | 20 µg | $397.00 |
HOXC6は、ヒトのホメオボックス型転写因子HoxC6をコードしており、DNA結合性の調節因子として胚発生期の前後軸(前後方向)のパターン形成や細胞運命決定の確立に関与します。分化した組織では、クロマチンやエンハンサー活性を規定する補因子との文脈依存的な相互作用を通じて、増殖・遊走・上皮分化を制御する転写プログラムに寄与します。HOXC6の発現異常は複数の腫瘍種で報告されており、系譜可塑性、浸潤に関連する遺伝子発現、分化状態の変化における役割が頻繁に研究されています。広範な転写制御能を持つ発生制御因子として、HOXC6は形態形成、がん性転写ネットワーク、遺伝子制御回路に関する研究において重要です。
HoxC6 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性HOXC6の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
HoxC6 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における HOXC6 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はHOXC6転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性HoxC6の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のHOXC6遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるHoxC6依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびHOXC6発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるHoxC6経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。