Plasmide CRISPR/Cas9 KO HoxC11 (h): sc-406796

Présentation

HOXC11 code le facteur de transcription à homéoboîte HoxC11, un régulateur se liant à l’ADN qui contribue à la mise en place du plan antéro-postérieur et de l’identité régionale au cours du développement, via un contrôle spécifique de la séquence des programmes d’expression génique. Dans les tissus différenciés, HoxC11 peut influencer les états de différenciation cellulaire et les réseaux transcriptionnels associés aux lignages, en interagissant avec des cofacteurs et la machinerie de régulation de la chromatine afin de modeler une transcription dépendante du contexte. Une expression dérégulée de HOXC11 a été rapportée dans de multiples contextes tumoraux et est fréquemment étudiée dans le cadre d’altérations plus larges des réseaux de gènes HOX, qui affectent la prolifération, l’invasion et la plasticité cellulaire. En tant que régulateur transcriptionnel, HoxC11 est pertinent pour l’étude des circuits de régulation génique du développement, du contrôle épigénétique de l’identité cellulaire et de la reprogrammation oncogénique.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO HoxC11 (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène HOXC11 dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du HOXC11, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert HOXC11 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine HoxC11.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en HOXC11 pour l'étude de la signalisation de HoxC11, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de HOXC11 essentiels à la fonction de HoxC11
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de HOXC11 pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le HoxC11 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le HoxC11 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus HOXC11. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le HoxC11 plasmide HDR (h) et le HoxC11 (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie HOXC11 pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles HOXC11 définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.