HoxC10 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m): sc-431637

Übersicht

Hoxc10 kodiert den Homeobox-Transkriptionsfaktor HoxC10, einen sequenzspezifischen DNA-bindenden Regulator, der während der Embryogenese zur Etablierung der anterior-posterioren Musterbildung und der Positionsidentität beiträgt. In der Mausentwicklung sind HOX-Programme in morphogengesteuerte Signalnetzwerke wie WNT-, FGF-, Retinsäure- und BMP-Signalwege eingebettet, um Linienfestlegung, axiale Skelettbildung und regionale Differenzierung zu koordinieren. Über die Entwicklung hinaus wird eine veränderte Regulation von HOX-Genen häufig mit fehlregulierten transkriptionellen Netzwerken in Verbindung gebracht, die die Aufrechterhaltung des Zellschicksals, Migration und Differenzierung beeinflussen. Eine Störung HOXC10-assoziierter Programme ist daher relevant für die Untersuchung angeborener Musterbildungsdefekte und von Transkriptions-Reprogrammierungsmechanismen, die an der Krankheitsbiologie beteiligt sind.

Das HoxC10 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des Hoxc10-Gens in mouse-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des Hoxc10-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von Hoxc10 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die HoxC10-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von Hoxc10-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der HoxC10-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf Hoxc10-Exone abzielen, die für die HoxC10-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere Hoxc10-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom HoxC10 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) und vom HoxC10 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des Hoxc10-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das HoxC10 HDR-Plasmid (m) und HoxC10 HDR-Plasmid (m2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von Hoxc10-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten Hoxc10-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.