Not CRISPR data: the image illustrates antibody quality for visualizing CRISPR experiment results.
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HoxB9 Double Nickase Plasmid (h): sc-401770-NIC
- Zielspezies: human
- 20 µg transfektionsfertige, aufgereinigte Plasmid DNA; geeignet für 20 Transfektionen
- Das HoxB9 Double Nickase Plasmid (h) wird als Plasmid-Paar geliefert. Die einzelnen Plasmide kodieren für eine D10A mutierte Cas9 Nuklease sowie für je eine unterschiedliche, zielspezifische 20nt guide RNA (gRNA) Sequenz. Dies erlaubt eine hohe Knockout-Effizienz bei gleichzeitig größerer Spezifität als das entsprechende CRISPR/Cas9 KO Plasmid
- gRNA Sequenzpaare liegen ca. 20 bp auseinander um ein spezifisches Cas9-vermitteltes "Double Nicking" der genomischen DNA zu erlauben und so im Resultat den Effekt eines Doppelstrangbruchs nachzuahmen.
- Ein Plasmid kodiert für ein Puromycin-Resistenzgen zur Selektion von stabilen Knockout-Zellen. Das andere Plasmid kodiert für ein GFP-Gen für den visuellen Nachweis der Transfektion
- HoxB9 Double-Nickase-Plasmid (h) und HoxB9 Double-Nickase-Plasmid (h2) kodieren unterschiedliche gepaarte gRNA-Designs, die auf HOXB9 abzielen. Möglicherweise ist eines oder sind beide Designs verfügbar
- Nach der Transfektion kann die Effizienz des Gen-Knockouts per Western Blot oder histologisch mit folgendem Antikörper überprüft werden: HoxB9: sc-398500
Bestellinformation
| Produkt | Katalog # | EINHEIT | Preis | ANZAHL | Favoriten | |
HoxB9 Double Nickase Plasmid (h) | sc-401770-NIC | 20 µg | $410.00 | |||
HoxB9 Double Nickase Plasmid (h2) | sc-401770-NIC-2 | 20 µg | $410.00 |
HOXB9 kodiert den Homeobox-Transkriptionsfaktor HoxB9, einen DNA-bindenden Regulator, der während der Embryogenese zur Etablierung der anterior-posterioren Musterbildung und der Gewebeidentität beiträgt. In menschlichen Zellen beeinflusst HoxB9 die Festlegung von Zelllinien und Differenzierungsprogramme, indem es Transkriptionsnetzwerke moduliert, die mit Morphogenese, Zellzykluskontrolle und epithelial-mesenchymaler Plastizität verknüpft sind. Eine fehlregulierte HOXB9-Expression wurde in mehreren Tumorkontexten mit onkogenen Transkriptionszuständen in Verbindung gebracht, unter anderem mit Effekten auf angiogene und invasive Gensignaturen; außerdem wird HOXB9 bei Entwicklungsstörungen untersucht, die mit veränderter Musterbildung einhergehen. Als Knotenpunkt in regulatorischen Schaltkreisen von Homeobox-Genen ist HoxB9 relevant, um Entwicklungsgen-Netzwerke und die transkriptionelle Kontrolle von Zellschicksalen zu analysieren.
HoxB9 Das Double-Nickase-Plasmid (h) besteht aus einem aufeinander abgestimmten Plasmidpaar, das für die hochspezifische Bearbeitung des HOXB9-Lokus in human-Zelllinien entwickelt wurde. Jedes Plasmid exprimiert eine Cas9-D10A-Nickase und eine spezifische sgRNA, die auf entgegengesetzte DNA-Stränge innerhalb von HOXB9 abzielt. Wenn sie auf benachbarte Stellen auf entgegengesetzten DNA-Strängen gerichtet sind, erzeugen die beiden Nickasen versetzte Einzelstrang-Schnitte, die zusammen einen versetzten Doppelstrangbruch erzeugen, was eine koordinierte On-Target-Aktivität beider Guides erfordert. Der resultierende DNA-Bruch wird durch endogene zelluläre Reparaturwege behoben, meist durch nicht-homologe Endverknüpfung (NHEJ), was zu Insertionen oder Deletionen führt, die die HOXB9-Funktion stören. Durch die Notwendigkeit einer doppelten sgRNA-Bindung am Zielort erhöht der Doppel-Nick-Ansatz die Spezifität der Bearbeitung und bietet eine komplementäre CRISPR-Strategie für Anwendungen, bei denen eine zusätzliche Kontrolle über die Zielgenauigkeit gewünscht ist.
Um eine effiziente Identifizierung editierter Zellen zu unterstützen, kodiert ein Plasmid GFP zur fluoreszierenden Visualisierung transfizierter Populationen, während das Begleitplasmid ein Puromycin-Resistenzgen für die Antibiotika-Selektion trägt. Zusammen unterstützen diese Merkmale eine effiziente Anreicherung co-transfizierter Populationen und vereinfachen die Validierung von Klonen mit HOXB9-Störung.
Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.