hnRNP D0 Double Nickase Plasmid (h): sc-401911-NIC
- Zielspezies: human
- 20 µg transfektionsfertige, aufgereinigte Plasmid DNA; geeignet für 20 Transfektionen
- Das hnRNP D0 Double Nickase Plasmid (h) wird als Plasmid-Paar geliefert. Die einzelnen Plasmide kodieren für eine D10A mutierte Cas9 Nuklease sowie für je eine unterschiedliche, zielspezifische 20nt guide RNA (gRNA) Sequenz. Dies erlaubt eine hohe Knockout-Effizienz bei gleichzeitig größerer Spezifität als das entsprechende CRISPR/Cas9 KO Plasmid
- gRNA Sequenzpaare liegen ca. 20 bp auseinander um ein spezifisches Cas9-vermitteltes "Double Nicking" der genomischen DNA zu erlauben und so im Resultat den Effekt eines Doppelstrangbruchs nachzuahmen.
- Ein Plasmid kodiert für ein Puromycin-Resistenzgen zur Selektion von stabilen Knockout-Zellen. Das andere Plasmid kodiert für ein GFP-Gen für den visuellen Nachweis der Transfektion
- hnRNP D0 Double-Nickase-Plasmid (h) und hnRNP D0 Double-Nickase-Plasmid (h2) kodieren unterschiedliche gepaarte gRNA-Designs, die auf HNRNPD abzielen. Möglicherweise ist eines oder sind beide Designs verfügbar
Bestellinformation
| Produkt | Katalog # | EINHEIT | Preis | ANZAHL | Favoriten | |
hnRNP D0 Double Nickase Plasmid (h) | sc-401911-NIC | 20 µg | $410.00 | |||
hnRNP D0 Double Nickase Plasmid (h2) | sc-401911-NIC-2 | 20 µg | $410.00 |
Das humane Gen **HNRNPD** kodiert hnRNP D0 (AUF1), ein RNA-bindendes Protein, das AU-reiche Elemente in 3′-UTRs erkennt und so die mRNA-Stabilität, den Abbau (Turnover) und die Translation reguliert. hnRNP D0 ist an posttranskriptionellen Kontrollnetzwerken beteiligt, die inflammatorische Signalwege, den Zellzyklus, Stressantworten und Differenzierung steuern, indem es den Abbau von Zytokin- und Immediate-Early-Transkripten moduliert. Es trägt außerdem zur RNA-Prozessierung und zur Dynamik von Ribonukleoprotein-Komplexen bei und verknüpft den RNA-Stoffwechsel mit Signalwegen wie der NF-κB-abhängigen Genexpression und der Biologie von Stressgranula. Eine dysregulierte hnRNP-D0-Aktivität wurde mit aberranten Entzündungsprogrammen und einer veränderten Expression von Genen in Zusammenhang gebracht, die Wachstum und Überleben betreffen, unter anderem in Kontexten von Krebs und neurodegenerationsrelevanten Prozessen, was seine Untersuchung als Regulator der Transkriptom-Homöostase unterstützt.
hnRNP D0 Das Double-Nickase-Plasmid (h) besteht aus einem aufeinander abgestimmten Plasmidpaar, das für die hochspezifische Bearbeitung des HNRNPD-Lokus in human-Zelllinien entwickelt wurde. Jedes Plasmid exprimiert eine Cas9-D10A-Nickase und eine spezifische sgRNA, die auf entgegengesetzte DNA-Stränge innerhalb von HNRNPD abzielt. Wenn sie auf benachbarte Stellen auf entgegengesetzten DNA-Strängen gerichtet sind, erzeugen die beiden Nickasen versetzte Einzelstrang-Schnitte, die zusammen einen versetzten Doppelstrangbruch erzeugen, was eine koordinierte On-Target-Aktivität beider Guides erfordert. Der resultierende DNA-Bruch wird durch endogene zelluläre Reparaturwege behoben, meist durch nicht-homologe Endverknüpfung (NHEJ), was zu Insertionen oder Deletionen führt, die die HNRNPD-Funktion stören. Durch die Notwendigkeit einer doppelten sgRNA-Bindung am Zielort erhöht der Doppel-Nick-Ansatz die Spezifität der Bearbeitung und bietet eine komplementäre CRISPR-Strategie für Anwendungen, bei denen eine zusätzliche Kontrolle über die Zielgenauigkeit gewünscht ist.
Um eine effiziente Identifizierung editierter Zellen zu unterstützen, kodiert ein Plasmid GFP zur fluoreszierenden Visualisierung transfizierter Populationen, während das Begleitplasmid ein Puromycin-Resistenzgen für die Antibiotika-Selektion trägt. Zusammen unterstützen diese Merkmale eine effiziente Anreicherung co-transfizierter Populationen und vereinfachen die Validierung von Klonen mit HNRNPD-Störung.
Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.