CTCF Gel Shift Oligonucleotides: sc-2613

CTCF-Gel-Shift-Oligonukleotide sind kurze DNA-Sequenzen, die für den Einsatz in Gel-Shift-Assays synthetisiert wurden, einer grundlegenden Technik in der molekularbiologischen Forschung zur Untersuchung von Protein-DNA-Interaktionen. Das Akronym "CTCF" steht für den CCCTC-bindenden Faktor, einen hochkonservierten Transkriptionsfaktor, der an verschiedenen zellulären Prozessen beteiligt ist, u. a. an der Transkriptionsregulation, der Chromatinorganisation und der genomischen Prägung. CTCF bindet an spezifische DNA-Sequenzen, die als CTCF-Bindungsstellen oder Isolatorsequenzen im Genom bekannt sind, wo er als vielseitiger Regulator der Genexpression fungiert, indem er die Chromatinstruktur moduliert und weitreichende Interaktionen zwischen entfernten Genomregionen ermöglicht. Durch die Verwendung von CTCF-Gel-Shift-Oligonukleotiden in Gel-Shift-Assays können Forscher die Bindungskinetik, Spezifität und Affinität von CTCF an seine Ziel-DNA-Sequenzen unter verschiedenen Versuchsbedingungen untersuchen. Diese Technik ermöglicht die Aufklärung der molekularen Mechanismen, die der CTCF-vermittelten Genregulation zugrunde liegen, und bietet Einblicke in die komplexe architektonische Organisation des Genoms.

Literaturhinweise:

1. Epigenetisches Silencing bei Friedreich-Ataxie ist mit einer Verarmung von CTCF (CCCTC-bindender Faktor) und Antisense-Transkription verbunden.  |  De Biase, I., et al. 2009. PLoS One. 4: e7914. PMID: 19956589
2. Identifizierung und funktionelle Charakterisierung von cis-regulatorischen Elementen, die die Expression des ADRB2-Gens vom Schwein kontrollieren.  |  Jaeger, A., et al. 2015. Int J Biol Sci. 11: 1006-15. PMID: 26221068