CHD6 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-413570

概要

CHD6（chromodomain helicase DNA-binding protein 6）は、CHDファミリーに属するATP依存性のクロマチンリモデリング因子であり、ヒストン修飾の認識とヌクレオソームの再配置を連動させることで転写プログラムを制御します。クロマチンの構造形成およびDNAを鋳型とする各種プロセスに関与し、クロマチンアクセシビリティの調節を介してRNAポリメラーゼII依存的な遺伝子発現やストレスに対する細胞応答に影響を与えます。エピジェネティック状態を形成することで、CHD6は分化・増殖・ゲノム安定性を制御する経路にも影響します。CHD6が関与するクロマチンリモデリングの異常は、がんやその他のエピジェネティック機能異常を伴う疾患で観察される転写ネットワークの変化と関連づけられており、機序解明研究の有用な標的となっています。

CHD6 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるCHD6遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、CHD6内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、CHD6のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、CHD6タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、CHD6シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、CHD6欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• CHD6の機能に不可欠なCHD6エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、CHD6ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• CHD6 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびCHD6 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、CHD6遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  CHD6 HDRプラスミド（h）および CHD6 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはCHD6ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のCHD6標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。