Not CRISPR data: the image illustrates antibody quality for visualizing CRISPR experiment results.
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Cdx2 Double Nickase Plasmid (h): sc-401220-NIC
- Zielspezies: human
- 20 µg transfektionsfertige, aufgereinigte Plasmid DNA; geeignet für 20 Transfektionen
- Das Cdx2 Double Nickase Plasmid (h) wird als Plasmid-Paar geliefert. Die einzelnen Plasmide kodieren für eine D10A mutierte Cas9 Nuklease sowie für je eine unterschiedliche, zielspezifische 20nt guide RNA (gRNA) Sequenz. Dies erlaubt eine hohe Knockout-Effizienz bei gleichzeitig größerer Spezifität als das entsprechende CRISPR/Cas9 KO Plasmid
- gRNA Sequenzpaare liegen ca. 20 bp auseinander um ein spezifisches Cas9-vermitteltes "Double Nicking" der genomischen DNA zu erlauben und so im Resultat den Effekt eines Doppelstrangbruchs nachzuahmen.
- Ein Plasmid kodiert für ein Puromycin-Resistenzgen zur Selektion von stabilen Knockout-Zellen. Das andere Plasmid kodiert für ein GFP-Gen für den visuellen Nachweis der Transfektion
- Cdx2 Double-Nickase-Plasmid (h) und Cdx2 Double-Nickase-Plasmid (h2) kodieren unterschiedliche gepaarte gRNA-Designs, die auf CDX2 abzielen. Möglicherweise ist eines oder sind beide Designs verfügbar
- Nach der Transfektion kann die Effizienz des Gen-Knockouts per Western Blot oder histologisch mit folgendem Antikörper überprüft werden: Cdx2: sc-393572
Bestellinformation
| Produkt | Katalog # | EINHEIT | Preis | ANZAHL | Favoriten | |
Cdx2 Double Nickase Plasmid (h) | sc-401220-NIC | 20 µg | $410.00 | |||
Cdx2 Double Nickase Plasmid (h2) | sc-401220-NIC-2 | 20 µg | $410.00 |
CDX2 kodiert den caudal-typischen Homeobox-Transkriptionsfaktor Cdx2, einen schicksalsbestimmenden Regulator, der für die Spezifikation des Trophektoderms und die Differenzierung des intestinalen Epithels essenziell ist. Cdx2 bindet an AT-reiche Promotor-/Enhancer-Elemente und steuert Genprogramme, die Zellpolarität, Proliferation und Reifung regulieren; dabei integriert es sich während der Darmentwicklung und -homöostase in Wnt/β-Catenin-, BMP- und Notch-assoziierte Transkriptionsnetzwerke. Eine fehlregulierte CDX2-Expression wird häufig als molekulares Merkmal in gastrointestinalen und anderen epithelialen Kontexten herangezogen, in denen veränderte Differenzierungszustände und Linienplastizität mit Tumorbiologie und aberrantem Schleimhaut-Remodeling verknüpft sind. Als nuklearer transkriptioneller Regulator ist Cdx2 ein gut zugänglicher Ansatzpunkt zur Untersuchung der chromatinabhängigen Kontrolle epithelialer Identität und stressadaptiver Reprogrammierung.
Cdx2 Das Double-Nickase-Plasmid (h) besteht aus einem aufeinander abgestimmten Plasmidpaar, das für die hochspezifische Bearbeitung des CDX2-Lokus in human-Zelllinien entwickelt wurde. Jedes Plasmid exprimiert eine Cas9-D10A-Nickase und eine spezifische sgRNA, die auf entgegengesetzte DNA-Stränge innerhalb von CDX2 abzielt. Wenn sie auf benachbarte Stellen auf entgegengesetzten DNA-Strängen gerichtet sind, erzeugen die beiden Nickasen versetzte Einzelstrang-Schnitte, die zusammen einen versetzten Doppelstrangbruch erzeugen, was eine koordinierte On-Target-Aktivität beider Guides erfordert. Der resultierende DNA-Bruch wird durch endogene zelluläre Reparaturwege behoben, meist durch nicht-homologe Endverknüpfung (NHEJ), was zu Insertionen oder Deletionen führt, die die CDX2-Funktion stören. Durch die Notwendigkeit einer doppelten sgRNA-Bindung am Zielort erhöht der Doppel-Nick-Ansatz die Spezifität der Bearbeitung und bietet eine komplementäre CRISPR-Strategie für Anwendungen, bei denen eine zusätzliche Kontrolle über die Zielgenauigkeit gewünscht ist.
Um eine effiziente Identifizierung editierter Zellen zu unterstützen, kodiert ein Plasmid GFP zur fluoreszierenden Visualisierung transfizierter Populationen, während das Begleitplasmid ein Puromycin-Resistenzgen für die Antibiotika-Selektion trägt. Zusammen unterstützen diese Merkmale eine effiziente Anreicherung co-transfizierter Populationen und vereinfachen die Validierung von Klonen mit CDX2-Störung.
Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.