CD138/SDC1/Syndecan-1 Double Nickaseプラスミド (m): sc-423235-NIC

Sdc1 は、細胞膜貫通型のヘパラン硫酸プロテオグリカンである Syndecan-1（CD138）をコードしており、細胞表面における細胞間・細胞―細胞外マトリックス（ECM）接着、増殖因子の提示、ケモカインの捕捉を制御する。CD138 は、ECM 成分や FGF、VEGF ファミリーなどのリガンドに結合することで、MAPK/ERK、PI3K/AKT、インテグリン依存的なフォーカルアドヒージョン動態を含むシグナル伝達経路を調節し、増殖、遊走、上皮バリア構造の形成に影響を与える。マウス組織では、Sdc1 は炎症シグナルの制御と ECM リモデリングを介して、免疫細胞間相互作用や創傷修復にも寄与する。CD138 の発現異常やシェディング（細胞表面からの切断・遊離）の異常は、がん生物学、炎症、組織恒常性の研究に関連する接着およびシグナル状態の変化と関連している。

CD138/SDC1/Syndecan-1 ダブルニカースプラスミド（m）は、mouse 細胞株における Sdc1 座の高特異性編集のために設計された、対となる2つのプラスミドから構成される。各プラスミドは、Cas9 D10Aニカースと、Sdc1内の対向するDNA鎖を標的とする異なるsgRNAを発現する。対向するDNA鎖上の隣接する部位に誘導されると、2つのニカースはオフセットした一本鎖切断を生成し、これらが組み合わさってずれた二本鎖切断を生じさせる。これにより、両方のガイドによる協調的なオンターゲット活性が必要となる。生じたDNA切断は、細胞内の内在性修復経路、特に非相同末端結合（NHEJ）によって修復され、その結果、Sdc1の機能を阻害する挿入または欠失が生じる。標的座標における2つのsgRNAの結合を必要とするこの二重ニッキング法は、編集の特異性を高め、標的精度に対するさらなる制御が求められる用途において、CRISPR戦略を補完するものである。

編集された細胞を効率的に同定するために、1つのプラスミドはトランスフェクトされた細胞集団を蛍光可視化するためのGFPをコードし、もう1つのプラスミドは抗生物質選別用のプロマイシン耐性遺伝子を保有しています。これらの機能により、共トランスフェクトされた細胞集団の効率的な濃縮が可能となり、Sdc1が破壊されたクローンの検証が簡素化されます。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。