Not CRISPR data: the image illustrates antibody quality for visualizing CRISPR experiment results.
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CD138/SDC1/Syndecan-1 Double Nickase Plasmid (m): sc-423235-NIC
- Zielspezies: mouse
- 20 µg transfektionsfertige, aufgereinigte Plasmid DNA; geeignet für 20 Transfektionen
- Das CD138/SDC1/Syndecan-1 Double Nickase Plasmid (m) wird als Plasmid-Paar geliefert. Die einzelnen Plasmide kodieren für eine D10A mutierte Cas9 Nuklease sowie für je eine unterschiedliche, zielspezifische 20nt guide RNA (gRNA) Sequenz. Dies erlaubt eine hohe Knockout-Effizienz bei gleichzeitig größerer Spezifität als das entsprechende CRISPR/Cas9 KO Plasmid
- gRNA Sequenzpaare liegen ca. 20 bp auseinander um ein spezifisches Cas9-vermitteltes "Double Nicking" der genomischen DNA zu erlauben und so im Resultat den Effekt eines Doppelstrangbruchs nachzuahmen.
- Ein Plasmid kodiert für ein Puromycin-Resistenzgen zur Selektion von stabilen Knockout-Zellen. Das andere Plasmid kodiert für ein GFP-Gen für den visuellen Nachweis der Transfektion
- CD138/SDC1/Syndecan-1 Double-Nickase-Plasmid (m) und CD138/SDC1/Syndecan-1 Double-Nickase-Plasmid (m2) kodieren unterschiedliche gepaarte gRNA-Designs, die auf Sdc1 abzielen. Möglicherweise ist eines oder sind beide Designs verfügbar
- Nach der Transfektion kann die Effizienz des Gen-Knockouts per Western Blot oder histologisch mit folgendem Antikörper überprüft werden: CD138/SDC1/Syndecan-1: sc-12765
Bestellinformation
| Produkt | Katalog # | EINHEIT | Preis | ANZAHL | Favoriten | |
CD138/SDC1/Syndecan-1 Double Nickase Plasmid (m) | sc-423235-NIC | 20 µg | $410.00 | |||
CD138/SDC1/Syndecan-1 Double Nickase Plasmid (m2) | sc-423235-NIC-2 | 20 µg | $410.00 |
Sdc1 kodiert Syndecan-1 (CD138), ein transmembranöses Heparansulfat-Proteoglykan, das Zell-Zell- und Zell-Matrix-Adhäsion, die Präsentation von Wachstumsfaktoren sowie die Sequestrierung von Chemokinen an der Zelloberfläche reguliert. Durch die Bindung an Komponenten der extrazellulären Matrix und an Liganden wie Mitglieder der FGF- und VEGF-Familie moduliert CD138 Signalwege einschließlich MAPK/ERK, PI3K/AKT und der integrinabhängigen Dynamik fokaler Adhäsionen und beeinflusst dadurch Proliferation, Migration und die Organisation epithelialer Barrieren. In Mausgeweben trägt Sdc1 über die Kontrolle inflammatorischer Signale und das Remodeling der extrazellulären Matrix zu Immunzellinteraktionen und Wundheilung bei. Eine fehlregulierte CD138-Expression oder -Abspaltung (Shedding) ist mit veränderten Adhäsions- und Signalzuständen verbunden, die für die Krebsbiologie, Entzündungsforschung und Untersuchungen der Gewebehomöostase relevant sind.
CD138/SDC1/Syndecan-1 Das Double-Nickase-Plasmid (m) besteht aus einem aufeinander abgestimmten Plasmidpaar, das für die hochspezifische Bearbeitung des Sdc1-Lokus in mouse-Zelllinien entwickelt wurde. Jedes Plasmid exprimiert eine Cas9-D10A-Nickase und eine spezifische sgRNA, die auf entgegengesetzte DNA-Stränge innerhalb von Sdc1 abzielt. Wenn sie auf benachbarte Stellen auf entgegengesetzten DNA-Strängen gerichtet sind, erzeugen die beiden Nickasen versetzte Einzelstrang-Schnitte, die zusammen einen versetzten Doppelstrangbruch erzeugen, was eine koordinierte On-Target-Aktivität beider Guides erfordert. Der resultierende DNA-Bruch wird durch endogene zelluläre Reparaturwege behoben, meist durch nicht-homologe Endverknüpfung (NHEJ), was zu Insertionen oder Deletionen führt, die die Sdc1-Funktion stören. Durch die Notwendigkeit einer doppelten sgRNA-Bindung am Zielort erhöht der Doppel-Nick-Ansatz die Spezifität der Bearbeitung und bietet eine komplementäre CRISPR-Strategie für Anwendungen, bei denen eine zusätzliche Kontrolle über die Zielgenauigkeit gewünscht ist.
Um eine effiziente Identifizierung editierter Zellen zu unterstützen, kodiert ein Plasmid GFP zur fluoreszierenden Visualisierung transfizierter Populationen, während das Begleitplasmid ein Puromycin-Resistenzgen für die Antibiotika-Selektion trägt. Zusammen unterstützen diese Merkmale eine effiziente Anreicherung co-transfizierter Populationen und vereinfachen die Validierung von Klonen mit Sdc1-Störung.
Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.