Date published: 2025-9-6

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C/EBP Gel Shift Oligonucleotides: sc-2525

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Datenblätter
  • consensus binding site for CCAAT enhancer binding proteins; supplied as 500 ng double-stranded DNA; sc-2525
  • also available as mutant oligonucleotide with the exception of an eight base pair substitution in the binding motif (TTG CGC AA→GAC TAG TC); sc-2526
  • 5'-TGC AGA TTG CGC AAT CTG CA-3'
  • also available as an agarose conjugate for use in purifying or enriching specific transcription factors; 15 µg in 0.25 ml packed beads; sufficient for 10 assays; use 25 µl beads per 0.5 - 1 mg total cell lysate protein, sc-2525 AC

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C/EBP-Gel-Shift-Oligonukleotide sind kurze DNA-Sequenzen, die für den Einsatz in Gel-Shift-Assays entwickelt wurden, einer grundlegenden Technik in der Molekularbiologie, die zur Untersuchung von Protein-DNA-Interaktionen eingesetzt wird. Diese Oligonukleotide wurden auf der Grundlage der Konsensus-Bindungssequenz des CCAAT/Enhancer-binding Proteins (C/EBP) hergestellt, einer Familie von Transkriptionsfaktoren, die für ihre entscheidende Rolle bei der Regulierung der Genexpression und der zellulären Differenzierung bekannt sind. C/EBP-Proteine binden an spezifische DNA-Sequenzen, die sich häufig in Enhancer- oder Promotorregionen von Zielgenen befinden, und modulieren deren Transkriptionsaktivität. Durch die Verwendung von C/EBP-Gel-Shift-Oligonukleotiden in Gel-Shift-Assays können Forscher die Bindungskinetik, Spezifität und Affinität von C/EBP-Proteinen an ihre Ziel-DNA-Sequenzen unter verschiedenen Versuchsbedingungen untersuchen. Diese Technik ermöglicht die Aufklärung der molekularen Mechanismen, die der C/EBP-vermittelten Genregulation zugrunde liegen, und bietet Einblicke in die komplexen Signalnetzwerke, die zelluläre Prozesse wie den Stoffwechsel, die Immunantwort und die Adipogenese steuern.

Literaturhinweise:

  1. Der Hepatozyten-Wachstumsfaktor aktiviert das CCAAT-Enhancer-Bindungsprotein und die Zellreplikation über den PI3-Kinase-Weg.  |  Cho, MK. and Kim, SG. 2003. Hepatology. 37: 686-95. PMID: 12601366
  2. Schnelle, sequenzielle Aktivierung von mitogen-aktivierten Proteinkinasen und Transkriptionsfaktoren geht der proinflammatorischen Zytokin-mRNA-Expression in der Milz von Mäusen voraus, die dem Trichothecen Vomitoxin ausgesetzt waren.  |  Zhou, HR., et al. 2003. Toxicol Sci. 72: 130-42. PMID: 12604842
  3. Hemmung der durch Lipopolysaccharid induzierbaren Stickoxid-Synthase-, TNF-alpha- und COX-2-Expression durch die Auswirkungen von Sauchinon auf die I-kappaBalpha-Phosphorylierung, C/EBP- und AP-1-Aktivierung.  |  Lee, AK., et al. 2003. Br J Pharmacol. 139: 11-20. PMID: 12746218
  4. Induktion von Cyclooxygenase-2 durch Rindertyp-I-Kollagen in Makrophagen über C/EBP- und CREB-Aktivierung durch mehrere Zellsignalwege.  |  Cho, MK., et al. 2004. Biochem Pharmacol. 67: 2239-50. PMID: 15163555
  5. Interleukin-6-induzierte Plasminogen-Genexpression in murinen Hepatozyten wird durch den Transkriptionsfaktor CCAAT/Enhancer Binding Protein beta (C/EBPbeta) vermittelt.  |  Bannach, FG., et al. 2004. J Thromb Haemost. 2: 2205-12. PMID: 15613028
  6. Glucocorticoide erhöhen die C/EBPbeta-Aktivität im Lungenepithel durch Phosphorylierung.  |  Berg, T., et al. 2005. Biochem Biophys Res Commun. 334: 638-45. PMID: 16009338
  7. Die 5'UTR des neurogenen bHLH-Gens Nex1/MATH-2/NeuroD6 wird von zwei verschiedenen Promotoren durch CRE- und C/EBP-Bindungsstellen reguliert.  |  Uittenbogaard, M., et al. 2007. J Neurosci Res. 85: 1-18. PMID: 17075921
  8. Ein neuartiger RBP-J kappa-abhängiger Wechsel von C/EBP beta zu C/EBP zeta an der C/EBP-Bindungsstelle auf dem C-reaktiven Protein-Promotor.  |  Singh, PP., et al. 2007. J Immunol. 178: 7302-9. PMID: 17513780
  9. Die Stimulierung der MAPK-Phosphatase-1-Genexpression durch Glukokortikoide erfolgt über einen Tethering-Mechanismus, an dem C/EBP beteiligt ist.  |  Johansson-Haque, K., et al. 2008. J Mol Endocrinol. 41: 239-49. PMID: 18682532
  10. Der aktivierende Transkriptionsfaktor 4 und das CCAAT/Enhancer-bindende Protein-beta regulieren das Säugetier-Target of Rapamycin negativ über die Redd1-Expression als Reaktion auf oxidativen und endoplasmatischen Retikulum-Stress.  |  Jin, HO., et al. 2009. Free Radic Biol Med. 46: 1158-67. PMID: 19439225
  11. Analyse der Il36a-Induktion durch C/EBPβ über ein Halb-CRE-C/EBP-Element in murinen Makrophagen in Abhängigkeit von seinem CpG-Methylierungsgrad.  |  Nerlich, A., et al. 2021. Genes Immun. 22: 313-321. PMID: 34697411
  12. Koexistenz von C/EBP alpha, beta, wachstumsinduzierten Proteinen und DNA-Synthese in Hepatozyten während der Leberregeneration. Auswirkungen auf die Aufrechterhaltung des differenzierten Zustands während des Leberwachstums.  |  Greenbaum, LE., et al. 1995. J Clin Invest. 96: 1351-65. PMID: 7657810
  13. Die DNA-Bindung durch C/EBP-Proteine korreliert mit der Proliferation von Hepatozyten.  |  Soriano, HE., et al. 1995. In Vitro Cell Dev Biol Anim. 31: 703-9. PMID: 8564082
  14. Klonierung des neuen humanen myeloischen Zell-spezifischen C/EBP-epsilon-Transkriptionsfaktors.  |  Chumakov, AM., et al. 1997. Mol Cell Biol. 17: 1375-86. PMID: 9032264
  15. Isoformspezifische Regulierung der CCAAT/Enhancer-binding-Protein-Familie von Transkriptionsfaktoren durch 3',5'-zyklisches Adenosinmonophosphat in Sertoli-Zellen.  |  Grønning, LM., et al. 1999. Endocrinology. 140: 835-43. PMID: 9927313

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C/EBP consensus oligonucleotide

sc-2525
500 ng/25 µl
$49.00

C/EBP Gel Shift Oligonukleotide

sc-2525 AC
15 µg/0.25 ml
$153.00

C/EBP mutant oligonucleotide

sc-2526
500 ng/25 µl
$49.00

C/EBP Gel Shift Oligonukleotide

sc-2526 AC
15 µg/0.25 ml
$153.00