BRD9 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m): sc-430581

Übersicht

Das Mausgen *Brd9* kodiert BRD9, einen bromodomänenhaltigen Chromatin-Reader, der Acetyl-Lysin-Markierungen auf Histonen erkennt und zur ATP-abhängigen Chromatin-Remodellierung beiträgt. BRD9 ist ein definierender Bestandteil nicht-kanonischer BAF-(ncBAF/GBAF)-Komplexe und unterstützt die Regulation von Enhancern und Promotoren sowie Transkriptionsprogramme, die Proliferation, Lineage-Festlegung und zelluläre Identität steuern. Über diese epigenetischen Funktionen beeinflusst BRD9 Signalwege, die mit DNA-Schadensantworten, Zellzykluskontrolle und Übergängen von Differenzierungszuständen verknüpft sind. Eine Fehlregulation der BRD9-assoziierten Chromatin-Remodellierung und Transkriptionsschaltkreise wurde in Zusammenhängen beschrieben, die für onkogene Abhängigkeiten und Entwicklungsphänotypen relevant sind, was BRD9 zu einem nützlichen Knotenpunkt für mechanistische Studien in Krankheitsmodellen macht.

Das BRD9 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des Brd9-Gens in mouse-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des Brd9-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von Brd9 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die BRD9-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von Brd9-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der BRD9-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf Brd9-Exone abzielen, die für die BRD9-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere Brd9-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom BRD9 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) und vom BRD9 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des Brd9-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das BRD9 HDR-Plasmid (m) und BRD9 HDR-Plasmid (m2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von Brd9-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten Brd9-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.