Arnt 2 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-403101

Descripción general

ARNT2 (translocador nuclear del receptor de hidrocarburos arílicos 2) codifica un factor de transcripción bHLH-PAS que forma heterodímeros con socios como miembros de la familia HIF para regular programas de expresión génica sensibles a estímulos. Arnt2 contribuye a las redes transcripcionales de detección de oxígeno y del desarrollo al facilitar la unión al ADN en elementos de respuesta a la hipoxia y coordinar el control de loci diana dependiente de la cromatina. Es altamente relevante para estudios de diferenciación neuronal y de adaptación celular al estrés metabólico o ambiental, donde la transcripción dependiente de ARNT2 puede influir en la supervivencia y en firmas génicas específicas de linaje. La desregulación de vías asociadas a ARNT2 se ha vinculado con alteraciones en las salidas de señalización hipóxica y con fenotipos del neurodesarrollo, lo que lo convierte en un nodo útil para la investigación mecanística de los circuitos transcripcionales con dominio PAS.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO Arnt 2 (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen ARNT2 en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del ARNT2 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de ARNT2 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína Arnt 2.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en ARNT2 para la investigación de la señalización de Arnt 2, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de ARNT2 críticos para la función de Arnt 2
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de ARNT2 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido Arnt 2 CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido Arnt 2 CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus ARNT2. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR Arnt 2 (h) y el plásmido HDR Arnt 2 (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología ARNT2 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana ARNT2 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.