ALKBH5 Double Nickase Plasmid (h): sc-412371-NIC
- Zielspezies: human
- 20 µg transfektionsfertige, aufgereinigte Plasmid DNA; geeignet für 20 Transfektionen
- Das ALKBH5 Double Nickase Plasmid (h) wird als Plasmid-Paar geliefert. Die einzelnen Plasmide kodieren für eine D10A mutierte Cas9 Nuklease sowie für je eine unterschiedliche, zielspezifische 20nt guide RNA (gRNA) Sequenz. Dies erlaubt eine hohe Knockout-Effizienz bei gleichzeitig größerer Spezifität als das entsprechende CRISPR/Cas9 KO Plasmid
- gRNA Sequenzpaare liegen ca. 20 bp auseinander um ein spezifisches Cas9-vermitteltes "Double Nicking" der genomischen DNA zu erlauben und so im Resultat den Effekt eines Doppelstrangbruchs nachzuahmen.
- Ein Plasmid kodiert für ein Puromycin-Resistenzgen zur Selektion von stabilen Knockout-Zellen. Das andere Plasmid kodiert für ein GFP-Gen für den visuellen Nachweis der Transfektion
- ALKBH5 Double-Nickase-Plasmid (h) und ALKBH5 Double-Nickase-Plasmid (h2) kodieren unterschiedliche gepaarte gRNA-Designs, die auf ALKBH5 abzielen. Möglicherweise ist eines oder sind beide Designs verfügbar
Bestellinformation
| Produkt | Katalog # | EINHEIT | Preis | ANZAHL | Favoriten | |
ALKBH5 Double Nickase Plasmid (h) | sc-412371-NIC | 20 µg | $410.00 | |||
ALKBH5 Double Nickase Plasmid (h2) | sc-412371-NIC-2 | 20 µg | $410.00 |
Humanes ALKBH5 kodiert eine Fe(II)/2-Oxoglutarat-abhängige Dioxygenase, die als N6-Methyladenosin-(m6A)-RNA-Demethylase fungiert und dadurch die epitranskriptomische Regulation des mRNA-Stoffwechsels prägt. Durch die Modulation von m6A-Spiegeln beeinflusst ALKBH5 RNA-Spleißen, nukleären Export, Translation und Stabilität und wirkt damit auf Programme ein, die den Zellzyklusverlauf, Stressanpassung und Differenzierung steuern. Die ALKBH5-Aktivität ist mit übergeordneten RNA-Prozessierungswegen verknüpft und kann die Expressionsdynamik onkogener und entwicklungsrelevanter Transkripte verändern. Eine fehlregulierte, ALKBH5-abhängige m6A-Umsatzkontrolle wurde mit krankheitsrelevanten Phänotypen in Verbindung gebracht, darunter aberrante Proliferation, veränderte stammzellähnliche Zustände sowie gestörte Immun- und metabolische Signalnetzwerke.
ALKBH5 Das Double-Nickase-Plasmid (h) besteht aus einem aufeinander abgestimmten Plasmidpaar, das für die hochspezifische Bearbeitung des ALKBH5-Lokus in human-Zelllinien entwickelt wurde. Jedes Plasmid exprimiert eine Cas9-D10A-Nickase und eine spezifische sgRNA, die auf entgegengesetzte DNA-Stränge innerhalb von ALKBH5 abzielt. Wenn sie auf benachbarte Stellen auf entgegengesetzten DNA-Strängen gerichtet sind, erzeugen die beiden Nickasen versetzte Einzelstrang-Schnitte, die zusammen einen versetzten Doppelstrangbruch erzeugen, was eine koordinierte On-Target-Aktivität beider Guides erfordert. Der resultierende DNA-Bruch wird durch endogene zelluläre Reparaturwege behoben, meist durch nicht-homologe Endverknüpfung (NHEJ), was zu Insertionen oder Deletionen führt, die die ALKBH5-Funktion stören. Durch die Notwendigkeit einer doppelten sgRNA-Bindung am Zielort erhöht der Doppel-Nick-Ansatz die Spezifität der Bearbeitung und bietet eine komplementäre CRISPR-Strategie für Anwendungen, bei denen eine zusätzliche Kontrolle über die Zielgenauigkeit gewünscht ist.
Um eine effiziente Identifizierung editierter Zellen zu unterstützen, kodiert ein Plasmid GFP zur fluoreszierenden Visualisierung transfizierter Populationen, während das Begleitplasmid ein Puromycin-Resistenzgen für die Antibiotika-Selektion trägt. Zusammen unterstützen diese Merkmale eine effiziente Anreicherung co-transfizierter Populationen und vereinfachen die Validierung von Klonen mit ALKBH5-Störung.
Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.