Chemische Aktivatoren von ZSCAN4F können dessen Aktivität über verschiedene biochemische Wege beeinflussen, indem sie den Phosphorylierungszustand des Proteins verändern, was ein gängiger Regulierungsmechanismus für die Proteinfunktion ist. Phorbol 12-Myristat 13-Acetat (PMA) ist ein starker Aktivator der Proteinkinase C (PKC), und die Aktivierung von PKC kann zur Phosphorylierung und anschließenden Aktivierung von ZSCAN4F führen. In ähnlicher Weise aktiviert Forskolin durch die Erhöhung des intrazellulären cAMP indirekt die Proteinkinase A (PKA). PKA kann dann ZSCAN4F phosphorylieren, was zu dessen Aktivierung führt. Ionomycin kann durch Erhöhung des intrazellulären Kalziumspiegels Kalzium/Calmodulin-abhängige Proteinkinasen aktivieren, die ihrerseits ZSCAN4F phosphorylieren und aktivieren können. Thapsigargin hemmt die Ca2+-ATPase des sarko-endoplasmatischen Retikulums (SERCA) und bewirkt einen Anstieg des intrazellulären Kalziumspiegels, der Kinasen aktiviert, die ZSCAN4F phosphorylieren können.
Darüber hinaus trägt Okadainsäure durch Hemmung der Proteinphosphatasen PP1 und PP2A dazu bei, ZSCAN4F in einem phosphorylierten und aktiven Zustand zu halten, da diese Phosphatasen andernfalls ZSCAN4F dephosphorylieren und deaktivieren würden. Anisomycin wirkt durch die Aktivierung von MAP-Kinase-Signalweg-Kinasen wie ERK, die ZSCAN4F phosphorylieren und aktivieren können. Zyklische AMP-Analoga wie Dibutyryl-cAMP und 8-Bromo-cAMP können PKA aktivieren, was zur Phosphorylierung von ZSCAN4F führt. Pervanadat sorgt durch die Hemmung von Tyrosinphosphatasen dafür, dass der Phosphorylierungszustand, der ZSCAN4F aktiviert, aufrechterhalten wird. Chelerythrin und Bisindolylmaleimid I können, obwohl sie in erster Linie PKC-Inhibitoren sind, zu einer kompensatorischen Aktivierung alternativer Kinasen führen, die ZSCAN4F phosphorylieren und aktivieren. Schließlich hemmt Calyculin A, ähnlich wie Okadainsäure, Proteinphosphatasen, die ZSCAN4F deaktivieren würden, wodurch ZSCAN4F in einem aktiven Zustand gehalten wird.
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