Chemische Inhibitoren von SBP-2 können über verschiedene Mechanismen seine Funktion behindern, die für die Synthese von Selenoproteinen entscheidend ist. Ebselen zum Beispiel kann die Enzymaktivitäten stören, die für den korrekten Einbau von Selenocystein, einer für die Aktivität von SBP-2 wesentlichen Aminosäure, erforderlich sind. Durch die Hemmung von Thioredoxin-Reduktasen und Glutathion-Peroxidasen stört Ebselen den Selenocystein-Einbauprozess und untergräbt die ordnungsgemäße Faltung und Funktion von SBP-2. In ähnlicher Weise greift Aurintricarbonsäure die Interaktion zwischen SBP-2 und SECIS-Elementen in der mRNA an, eine für die Synthese von Selenoproteinen notwendige Bindung. Diese Bindung ist entscheidend für die Rolle von SBP-2 bei der Translation von Selenoprotein-mRNAs, und ihre Hemmung durch Aurintricarboxylsäure beeinträchtigt die Funktion von SBP-2. Methylenblau wirkt sich auf SBP-2 aus, indem es das Redox-Gleichgewicht in der Zelle verändert, das für die redoxabhängigen Aktivitäten von SBP-2 wesentlich ist. Da SBP-2 aufgrund seiner Rolle beim Einbau von Selenocystein empfindlich auf das Redoxmilieu reagiert, kann der Redoxzyklus durch Methylenblau seine Funktion beeinträchtigen.
Ethacrynsäure und Buthioninsulfoximin zielen auf den Glutathion-Stoffwechsel ab, der indirekt mit der Aktivität von SBP-2 verbunden ist. Ethacrynsäure hemmt die Glutathion-S-Transferase, was möglicherweise die Reifung von Selenoproteinen beeinträchtigt, während Buthioninsulfoximin die Glutathionsynthese unterdrückt, was den für die SBP-2-Aktivität erforderlichen zellulären Redoxzustand stören kann. Schwermetallverbindungen wie Cadmiumchlorid und Blei(II)-acetat können SBP-2 durch die Verdrängung von Metallionen, die für seine Aktivität entscheidend sind, oder durch Bindung an Thiolgruppen, die für die Konformation und Funktion des Proteins wichtig sind, hemmen. Der Metallchelator Clioquinol könnte essentielle Metallionen von SBP-2 abspalten und dadurch dessen Funktion hemmen. Das quecksilberhaltige Thimerosal bindet an Thiole und kann thiolabhängige Domänen in SBP-2 hemmen, was zu einer Funktionsstörung führt. Chloroquin kann durch Interkalation in DNA und RNA die für die Funktion von SBP-2 notwendigen Protein-RNA-Interaktionen hemmen. Schließlich kann Menadion durch seine Redoxzyklus-Fähigkeit die Redoxumgebung verändern, von der SBP-2 abhängt, und somit als Inhibitor wirken, indem es die für die ordnungsgemäße Funktion von SBP-2 erforderlichen Redoxbedingungen verändert.
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