PDE6C-Inhibitoren sind eine Klasse chemischer Verbindungen, die speziell darauf ausgerichtet sind, mit der Phosphodiesterase 6C (PDE6C), einem Enzym aus der Familie der Phosphodiesterasen, in Wechselwirkung zu treten und ihre Aktivität zu hemmen. Phosphodiesterase-Enzyme sind an der Regulierung des intrazellulären Spiegels von zyklischen Nukleotiden, zyklischem Adenosinmonophosphat (cAMP) und zyklischem Guanosinmonophosphat (cGMP) beteiligt. Insbesondere PDE6C ist dafür bekannt, cGMP zu hydrolysieren, das ein wichtiges Signalmolekül bei verschiedenen biologischen Prozessen ist. Als Mitglied der PDE6-Unterfamilie unterscheidet sich PDE6C strukturell von anderen Phosphodiesterasen und hat ein einzigartiges gewebespezifisches Expressionsmuster und eine funktionelle Rolle. Die Hemmung von PDE6C würde zu veränderten cGMP-Spiegeln in den Zellen führen, in denen es exprimiert wird. PDE6C-Inhibitoren müssten sorgfältig konstruiert werden, um sicherzustellen, dass sie für PDE6C selektiv sind und nicht für andere Mitglieder der PDE-Familie, um unbeabsichtigte Auswirkungen auf andere cGMP- oder cAMP-Signalwege zu vermeiden.
Bei der Entwicklung und Synthese von PDE6C-Inhibitoren würde wahrscheinlich eine Kombination aus strukturbasiertem Wirkstoffdesign und Hochdurchsatz-Screening zum Einsatz kommen, um chemische Gerüste zu identifizieren, die an das aktive Zentrum des Enzyms binden können. Angesichts der Spezifität, die für eine selektive Hemmung von PDE6C erforderlich ist, wäre die Kenntnis der dreidimensionalen Struktur des Enzyms von entscheidender Bedeutung. Das aktive Zentrum von PDE6C, in dem cGMP gebunden wird, ist durch eine Tasche gekennzeichnet, die Aminosäurereste enthält, die für die Koordination der Bindung und anschließenden Hydrolyse von cGMP verantwortlich sind. Inhibitoren werden so konzipiert, dass sie in diese Tasche passen und Wechselwirkungen mit Schlüsselresten bilden, um den Zugang zu cGMP zu blockieren oder das Enzym in einer inaktiven Konformation zu stabilisieren. Dies könnte die Bildung von Wasserstoffbrücken, hydrophoben Wechselwirkungen und möglicherweise die Koordination mit Metallionen im aktiven Zentrum beinhalten, die für die katalytische Aktivität wesentlich sind.
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