Wortmannin und ZM-447439 zum Beispiel können Signalwege unterbrechen, die mit dem Überleben, dem Wachstum und der Teilung von Zellen zusammenhängen, indem sie PI3K- bzw. Aurora-Kinasen hemmen. Diese Unterbrechung kann sich kaskadenartig auf die Funktion und Regulierung von Proteinen auswirken, die an diesen wichtigen zellulären Prozessen beteiligt sind. In ähnlicher Weise kann die Wirkung von SB431542 auf den TGF-beta-Rezeptor zelluläre Reaktionen in Bezug auf Proliferation und Differenzierung modulieren, indem Proteine beeinflusst werden, die auf diese Signale reagieren.
KN-93 und PD0325901 bieten Einblicke in die Modulation von Signalen durch die Beeinflussung von kalziumabhängigen Prozessen bzw. des MAPK/ERK-Signalwegs. Ersteres kann Proteine beeinflussen, die durch Kalzium-Signale reguliert werden, während letzteres Auswirkungen auf Proteine hat, die an Zellteilungs- und Differenzierungsprozessen beteiligt sind. Verbindungen wie Leflunomid und Go6976 können durch Hemmung der Dihydroorotatdehydrogenase und der Proteinkinase C zu Veränderungen bei der DNA-Synthese und der Regulierung des Zellzyklus bzw. der Apoptose führen. 2-Methoxyestradiol und 17-AAG zielen dagegen auf die strukturellen Komponenten der Zelle und die Proteinstabilität ab und beeinflussen die Zellmitose, die Angiogenese und die Stabilität verschiedener Kundenproteine. Thapsigargin und LY-333,531 Hydrochlorid können den intrazellulären Kalziumspiegel und spezifische Signaltransduktionswege stören, was weitreichende Auswirkungen auf die durch diese Signale regulierten Proteine haben kann. Schließlich kann die Hemmung der Cyclooxygenase-2 durch NS-398 Proteine beeinflussen, die an der Produktion von Entzündungsmediatoren beteiligt sind.
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