Inhibitoren des Phosphoinositid-3-Kinase (PI3K)-Wegs wie Wortmannin und LY294002 üben ihren Einfluss aus, indem sie Signalkaskaden stoppen, die für zahlreiche zelluläre Reaktionen entscheidend sind, einschließlich derer, die möglicherweise von C9orf71 gesteuert werden. In ähnlicher Weise wird der Bereich der mitogen-aktivierten Proteinkinase (MAPK) von Wirkstoffen wie PD98059 und U0126 angegriffen, die als MEK-Inhibitoren den MAPK/ERK-Signalweg behindern und somit Prozesse stören könnten, bei denen C9orf71 eine regulierende Rolle spielt. Das Mammalian Target of Rapamycin (mTOR) ist ein weiterer wichtiger Akteur bei Zellwachstum und -proliferation, und sein Inhibitor, Rapamycin, kann solche zellulären Aktivitäten verändern und überschneidet sich möglicherweise mit dem Einflussbereich von C9orf71. Parallel dazu könnte die TGF-β-Rezeptorkinase, die durch SB431542 gehemmt wird, verschiedene zelluläre Prozesse beeinflussen, an denen C9orf71 beteiligt sein könnte, und so die Zelldifferenzierung und Homöostase beeinflussen.
Mit SP600125, einem JNK-Inhibitor, der die Stressreaktion und apoptotische Wege modifiziert, und Y-27632, einem ROCK-Inhibitor, der sich auf die Dynamik des Zytoskeletts und damit auf C9orf71-bezogene Mechanismen auswirken könnte, kommen weitere Ebenen der Regulierung ins Spiel. Durch die Störung des intrazellulären Kalziumspiegels wirkt Thapsigargin auf die SERCA-Pumpe, was sich auf das Signalmilieu auswirkt, in dem sich C9orf71 bewegen könnte. Auch die Stoffwechsellandschaft ist gegen diese Einflüsse nicht immun, wie 2-Desoxy-D-Glukose zeigt, die die Glykolyse unterbricht und damit möglicherweise den Stoffwechselkontext, in dem C9orf71 agiert, neu gestaltet. In ähnlicher Weise könnte die Wirkung von Brefeldin A auf die Funktion des Golgi-Apparats zu Veränderungen im Proteinverkehr und in der Proteinlokalisierung führen und die zelluläre Rolle von C9orf71 beeinflussen. Die Hemmung der apoptotischen Maschinerie durch Z-VAD-FMK, einen Pan-Caspase-Inhibitor, bietet einen weiteren Weg, über den die Aktivität von C9orf71 moduliert werden könnte.
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