ZNF426の化学的阻害剤は、様々なシグナル伝達経路と相互作用して、タンパク質の機能に対する阻害効果を発揮することができる。スタウロスポリンは、幅広いタンパク質キナーゼ阻害剤であり、リン酸化過程に不可欠なキナーゼを阻害する。このような阻害は、ZNF426の機能的なコンフォメーションと活性に重要な、必要なリン酸化イベントを妨げることにより、ZNF426に直接影響を与えることができる。mTORを標的とするラパマイシンや、PI3K阻害剤であるLY294002とWortmanninは、ZNF426の活性に重要であると思われる上流のシグナル伝達を阻害する。これらのキナーゼの阻害は、ZNF426自身あるいはZNF426と相互作用しZNF426の活性を制御する他のタンパク質を含む、下流の標的のリン酸化の減少につながる可能性がある。
さらなる阻害作用としては、MEKを標的とするU0126とPD98059、そしてJNKの阻害剤であるSP600125がある。これらの阻害剤は、ZNF426の機能に必要な制御過程に関与しうるERKおよびJNKシグナル伝達経路をそれぞれ減少させることになる。SB203580 によるp38 MAPKの阻害は、p38 MAPKがZNF426と機能的に類似したタンパク質を制御しうるもう一つの経路であることから、キナーゼ相互作用の複雑さをさらに示している。ダサチニブはSrcファミリーキナーゼを阻害し、H-89はPKA阻害剤として、ZNF426の活性に必要不可欠なリン酸化イベントを阻止することができる。キレリスリンのPKC阻害もまた、ZNF426の機能に不可欠なシグナル伝達経路を阻害する。最後に、プロテアソーム阻害剤であるボルテゾミブは、ZNF426の負の制御因子を含むと思われるユビキチン化タンパク質の蓄積を引き起こし、細胞内でのタンパク質の分解と回転速度を変化させることにより、間接的にその機能を阻害する。キナーゼ経路とプロテアソーム分解の複雑なネットワークは、ZNF426の活性が阻害されうる複数のレベルを浮き彫りにし、細胞内シグナル伝達とタンパク質制御の相互関連性を示唆している。
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