ZNF225の化学的阻害剤は、遺伝子の転写制御におけるその役割に影響を与える様々なメカニズムでタンパク質を阻害することができる。ChelerythrineはDNAにインターカレートすることができ、それによってZNF225のDNA結合能を阻害し、結果としてその転写調節機能を阻害する。同様に、トリプトライドはZNF225のDNA結合と転写活性に重要な転写因子の活性を低下させることによって作用する。ウィタフェリンAは、ZNF225が転写を制御するために依存している必要なタンパク質間相互作用を破壊する。クルクミンは転写因子活性を調節し、ZNF225と核因子の相互作用を変化させ、遺伝子発現を調節するZNF225の能力を低下させる。ゲニステインは、ZNF225と相互作用するタンパク質のリン酸化を担うチロシンキナーゼを阻害し、遺伝子発現における機能的役割に不可欠である。
さらに、ボルテゾミブは、IκBを安定化させることによってZNF225を阻害し、その結果、遺伝子発現の調節においてZNF225と相互作用しうる因子であるNF-κBを阻害する。Bay 11-7082 もまた、ZNF225 が介在する遺伝子制御に関与する可能性のある NF-κB の活性化を標的としている。MG132はプロテアソーム活性を標的とし、それによってZNF225の機能を制御する制御タンパク質のターンオーバーに間接的に影響を与える。PD169316とSB202190はともに、ZNF225が相互作用する転写因子のリン酸化に関与するp38 MAPK経路を阻害し、ZNF225が介在する転写活性化を抑制する。LY294002はPI3Kを阻害し、AKTの活性化に影響を与え、ZNF225の機能に関与する下流のタンパク質に影響を与える可能性がある。最後に、SN-38はトポイソメラーゼIを阻害し、ZNF225の活性に関連するDNA複製と転写プロセスに影響を与える。
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