ZNF161の化学的阻害剤は、遺伝子制御におけるZNF161の機能に不可欠な様々なシグナル伝達経路や分子過程を標的とすることで、その活性を調節することができる。PD98059とU0126は、MAPK/ERK経路に作用する2つのそのような阻害剤である。PD98059は、ERKの上流のキナーゼであるMEKを阻害することにより機能し、ERKのリン酸化とその後の活性化を低下させる。その結果、ZNF161によって共制御されている転写因子の活性が低下する。同様に、U0126はMEK1/2を特異的に阻害し、MAPK/ERK経路の活性化も阻害するため、関連する転写因子の活性が低下し、ZNF161とその標的遺伝子との相互作用が制限される可能性がある。
ZNF161に影響を与える他の阻害剤には、LY294002とWortmanninがあり、どちらもPI3K/Akt経路を阻害する。LY294002はPI3Kを阻害することによってこれを達成し、それによってAktのリン酸化を低下させ、ZNF161が共同調節因子として働く転写事象を阻害することができる。Wortmanninは、PI3K阻害剤として作用することにより、同様にPI3K/Akt経路を阻害し、ZNF161が関与する転写調節を減少させる可能性がある。mTORの阻害剤であるラパマイシンは、同様に転写事象に影響を与えることができ、mTORを阻害することによって、ZNF161と連動して働く転写因子や共調節タンパク質の活性を低下させる可能性がある。HDAC阻害剤であるトリコスタチンAとアピシジンは、いずれもヒストンの過剰アセチル化を引き起こし、ZNF161がクロマチンと相互作用する能力を阻害し、転写調節におけるその役割を阻害する可能性がある。一方、DNAメチル化酵素阻害剤である5-アザシチジンは、DNAの低メチル化を引き起こし、メチル化されたDNA領域へのZNF161の結合を阻害し、その制御機能を阻害する。KN-93はCaMKIIを阻害し、転写因子を制御するカルシウムシグナル伝達経路に影響を与え、おそらくZNF161とその標的遺伝子との相互作用の低下につながる。幅広いキナーゼ阻害剤であるスタウロスポリンは、ZNF161の機能に重要なタンパク質をリン酸化するキナーゼを阻害する可能性がある。最後に、SB203580とSP600125は、それぞれp38 MAPキナーゼとJNKを標的とし、ZNF161が共制御する可能性のある転写因子の活性を低下させる可能性があり、それによってZNF161の遺伝子発現調節能力を機能的に阻害する。
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