ZNF146には、タンパク質の構造や機能に影響を与える様々な金属や低分子が含まれている。このタンパク質はジンクフィンガータンパク質ファミリーに属するため、亜鉛はZNF146の構造的完全性において基礎的な役割を果たしている。亜鉛イオンの存在は、ZNF146が適切にフォールディングされ、DNAと効果的に相互作用するために極めて重要である。同様に、塩化マグネシウムに含まれるマグネシウムなどの他の金属イオンも、ジンクフィンガードメインのコンフォメーションに影響を与えることが知られている。マグネシウムイオンはその構造を安定化させることにより、ZNF146のDNA結合能力を高めることができる。塩化コバルト(II)のコバルト、硫酸ニッケル(II)のニッケル、硫酸銅(II)の銅のような遷移金属は、亜鉛フィンガーモチーフの亜鉛を置換することができる。この置換は、DNA結合を促進する可能性のあるコンフォメーション状態の変化により、ZNF146の活性化型につながる可能性がある。さらに、塩化カドミウム由来のカドミウムもジンクフィンガーモチーフと相互作用することができ、同様の構造変化によってZNF146の活性化につながる可能性がある。
金属イオンに加えて、低分子の阻害剤や活性化剤もZNF146の活性に影響を与える可能性がある。オルソバナジン酸ナトリウムはリン酸化酵素を阻害し、ZNF146と相互作用するタンパク質のリン酸化状態を維持し、活性化につながる可能性がある。フォルスコリンは、cAMPレベルを上昇させることで、プロテインキナーゼA(PKA)を活性化することができ、PKAはZNF146に関連するタンパク質をリン酸化して活性化し、その機能を増強することができる。5-アザシチジンのようなDNAメチル化酵素阻害剤は、クロマチン構造を変化させ、DNA結合部位へのアクセス性を高めることによってZNF146を活性化する。トリコスタチンAや酪酸ナトリウムのようなヒストン脱アセチル化酵素阻害剤は、クロマチンのリモデリングを引き起こし、DNAとの相互作用を促進することによってZNF146を活性化する。さらに、PMA(Phorbol 12-myristate 13-acetate)はプロテインキナーゼC(PKC)を活性化し、ZNF146の活性を増強する制御タンパク質をリン酸化し、細胞内での機能的活性化に寄与する。
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