YPEL4は、その活性を調節するために様々なシグナル伝達経路に関与している。アデニル酸シクラーゼを直接活性化することで知られるフォルスコリンは、細胞内のサイクリックAMP(cAMP)レベルの上昇に極めて重要な役割を果たす。このcAMPの急増は、プロテインキナーゼA(PKA)の活性化につながる重要なシグナルであり、PKAは次にYPEL4をリン酸化することによってYPEL4に作用し、その活性を高める。同様に、βアドレナリン作動薬であるイソプロテレノールとPGE2は、Gタンパク質共役型受容体との相互作用を通して、アデニル酸シクラーゼを刺激し、その結果、cAMP産生が増加し、続いてPKAを活性化する。活性化されたPKAはYPEL4をリン酸化し、その結果活性化される。
IBMXとロリプラムは、ホスホジエステラーゼを阻害することによってcAMPの分解を防ぎ、それによってPKAの活性を維持し、YPEL4のリン酸化と活性化を促進する。アニソマイシンは、タンパク質合成阻害剤という異なるメカニズムで作用するが、ストレス活性化プロテインキナーゼの活性化を引き起こし、間接的にYPEL4の活性化につながる可能性がある。エピネフリンとテルブタリンは、ともにアドレナリン受容体に関与し、アデニル酸シクラーゼを刺激してcAMPを増加させ、その結果PKAを活性化し、YPEL4を標的とする。プロテインキナーゼCを介して作用するPMAと、細胞内カルシウムレベルを上昇させるイオノマイシンは、異なるキナーゼを活性化し、これらもまたYPEL4のリン酸化と活性化に集中する可能性がある。BAY 60-6583とシロスタゾールはともにアデニル酸シクラーゼ活性とcAMPレベルを増幅し、PKAシグナル伝達カスケードを強化し、YPEL4のリン酸化とその結果としての活性化を促進する。これらの化学的活性化因子は、それぞれ異なるがしばしば交差する経路を通して、YPEL4のリン酸化状態と活性を制御し、このタンパク質に収束する細胞内シグナルの複雑なネットワークを描き出している。
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