Os activadores do WDR42C funcionam através de vários mecanismos bioquímicos para aumentar a sua atividade na célula. Alguns activadores aumentam diretamente os níveis intracelulares de AMP cíclico (cAMP), que por sua vez ativa a proteína quinase A (PKA). A PKA activada fosforila então um conjunto de proteínas, algumas das quais estão intimamente envolvidas na regulação do WDR42C, levando à sua ativação. De forma análoga, os activadores que funcionam como análogos do diacilglicerol (DAG) activam a proteína quinase C (PKC), que fosforila proteínas que modulam a função do WDR42C, resultando na sua ativação. Além disso, os compostos que elevam as concentrações de cálcio intracelular desencadeiam a ativação de proteínas quinases dependentes do cálcio que podem fosforilar alvos associados ao WDR42C, facilitando assim a sua ativação funcional.
Outros compostos actuam como agonistas adrenérgicos, que também elevam os níveis de cAMP e activam a PKA, levando à fosforilação de proteínas que influenciam a atividade do WDR42C. Do mesmo modo, a ativação da proteína quinase activada por AMP (AMPK) por activadores específicos pode levar à fosforilação de proteínas a jusante que regulam o WDR42C, promovendo indiretamente a sua ativação. Além disso, certas moléculas que geram espécies reactivas de oxigénio, como o peróxido de hidrogénio, podem ativar cinases através de mecanismos oxidativos; estas cinases podem ter como alvo substratos que interagem com o WDR42C, culminando na sua ativação. A inibição das proteínas fosfatases por activadores específicos também contribui para o aumento do estado de fosforilação das proteínas celulares, que pode incluir as que aumentam diretamente a atividade do WDR42C.
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