Vmn2r50 comprende una vasta gamma di composti che possono inibire l'attività della proteina attraverso meccanismi diversi. La benzamidina, un inibitore della serina proteasi, può inibire Vmn2r50 mirando alla sua funzione proteolitica, il che suggerisce che Vmn2r50 possa avere un dominio simile alla serina proteasi che è cruciale per la sua attività. Marimastat può inibire Vmn2r50 impedendo il rimodellamento della matrice extracellulare, indicando un'interazione tra Vmn2r50 e la matrice extracellulare. L'EDTA è un agente chelante e la sua inibizione di Vmn2r50 segnala l'importanza degli ioni metallici come cofattori per l'attività della proteina. La Diprotina A può interrompere l'attività di Vmn2r50 inibendo la dipeptidil peptidasi-IV, che potrebbe essere coinvolta nell'elaborazione o nell'attivazione di Vmn2r50.
E-64 serve a inibire Vmn2r50 attraverso la sua azione sulle proteasi cisteiniche, il che implica che l'attività o la regolazione di Vmn2r50 può dipendere dall'attività delle proteasi cisteiniche. L'ossido di fenilarsina può legarsi ai gruppi tiolici e la sua inibizione di Vmn2r50 suggerisce che gli enzimi reattivi ai tioli svolgono un ruolo nella funzione della proteina. Il fosforamidone, inibendo le metalloproteasi, può influenzare Vmn2r50, il che potrebbe indicare che l'attività delle metalloproteasi è coinvolta nella regolazione o nell'attivazione di Vmn2r50. GW4869 può inibire Vmn2r50 alterando la segnalazione degli sfingolipidi, il che è indicativo di un'associazione funzionale tra Vmn2r50 e il metabolismo degli sfingolipidi. PD 98059 e LY294002 inibiscono Vmn2r50 bloccando rispettivamente MEK1/2 e PI3 chinasi, indicando che l'attività di Vmn2r50 è intrecciata con queste vie di segnalazione. L'inibizione di Vmn2r50 da parte di ML-7 attraverso l'inibizione della chinasi della catena leggera della miosina indica un ruolo delle dinamiche citoscheletriche nella regolazione dell'attività di Vmn2r50. Infine, ZINC13466751, un composto identificato attraverso uno screening virtuale, è in grado di inibire Vmn2r50 legandosi direttamente alla proteina, il che suggerisce la presenza di uno specifico sito di legame o di una struttura all'interno di Vmn2r50 che è cruciale per la sua attività.
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