ウロプラキンIIIb(UPIIIb)の化学的阻害剤は、多様な生化学的メカニズムを通じて機能し、タンパク質の活性を阻害する。フロレチンは、UPIIIbの適切なフォールディングと機能にとって極めて重要なグリコシル化プロセスを標的とすることにより、UPIIIbに影響を与える。グリコシル化が阻害されると、UPIIIbはその構造や細胞膜内での役割を維持できなくなる。同様に、イオノフォアであるモネンシンは、UPIIIbの輸送や局在化を含む細胞内プロセスに不可欠なナトリウムイオン勾配を破壊する。イオン濃度を変化させることにより、モネンシンはUPIIIbの機能に不可欠な輸送機構を阻害することができる。一方フィリピンは、UPIIIbが局在する脂質ラフトの維持に重要な成分である膜コレステロールに結合する。コレステロールと相互作用することで、フィリピンはこれらのミクロドメインを破壊し、UPIIIbの活性を阻害することができる。
さらに、オカダ酸はPP1やPP2Aのようなタンパク質リン酸化酵素を阻害する。PP1やPP2Aは、UPIIIbの機能制御にとって重要なステップであるタンパク質の脱リン酸化を担う。したがって、これらの酵素の阻害はUPIIIb活性の低下をもたらす。カルホスチンCとビスインドリルマレイミドIは、UPIIIbのシグナル伝達経路を制御するリン酸化反応に不可欠なプロテインキナーゼC(PKC)を特異的に阻害する。これらの化合物によるPKCの阻害はUPIIIb活性の低下につながる。同様に、塩酸W-7はUPIIIbの機能を制御するカルシウムシグナル伝達経路に関与するカルモジュリンを阻害する。プロテインキナーゼA(PKA)阻害剤であるKT5720と汎PKC阻害剤であるGö 6983は、UPIIIbのシグナル伝達経路内のタンパク質のリン酸化を阻害し、UPIIIbの活性を低下させる。最後に、PD 98059とLY294002はそれぞれ、UPIIIbが関与すると思われる経路の上流制御因子であるMEKとPI3Kのような特定のキナーゼを標的とする。これらのキナーゼを阻害することで、UPIIIbの細胞内での活性をダウンレギュレーションすることができる。
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