Gli inibitori chimici di TTC36 possono agire attraverso varie vie cellulari per inibire la funzione di questa specifica proteina. La staurosporina, un inibitore di chinasi ad ampio spettro, può impedire la fosforilazione di TTC36, ipotizzando che la sua attivazione o funzione dipenda da questa modificazione post-traslazionale. Allo stesso modo, wortmannin e LY294002, entrambi inibitori della fosfoinositide 3-chinasi (PI3K), possono interferire con la segnalazione PI3K che potrebbe essere necessaria per la conformazione funzionale o la localizzazione di TTC36 all'interno della cellula. U0126 e PD98059 sono entrambi inibitori selettivi di MEK, parte della via MAPK/ERK, che, se coinvolta nella regolazione di TTC36, può portare alla sua inibizione funzionale bloccando questa particolare via. SB203580 e SP600125, che hanno come bersaglio rispettivamente p38 MAPK e JNK, possono inibire TTC36 se è modulato da queste vie di segnalazione MAPK.
La rapamicina inibisce mTOR e se TTC36 opera a valle della segnalazione di mTOR, l'inibizione funzionale di TTC36 può essere ottenuta attraverso l'inibizione di mTOR da parte della rapamicina. PP2 e Lestaurtinib, entrambi inibitori delle tirosin-chinasi, possono ostacolare l'attività di TTC36 se questa è regolata dalla segnalazione delle tirosin-chinasi. GF109203X e Go6983, entrambi inibitori della protein chinasi C (PKC), possono sopprimere la funzione di TTC36 inibendo la segnalazione mediata da PKC che TTC36 potrebbe richiedere per la sua attività. Ciascuna di queste sostanze chimiche interagisce con specifiche vie di segnalazione o enzimi che si ipotizza influenzino l'attività di TTC36, portando all'inibizione di TTC36 attraverso una cascata di eventi cellulari che iniziano con l'inibizione dei regolatori a monte o con eventi diretti di fosforilazione.
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