Chemische Inhibitoren von TRIM40 können ihre Wirkung durch die Hemmung des Proteasoms entfalten, einem Komplex, der ubiquitinierte Proteine abbaut. Da TRIM40 an der Markierung von Proteinen für den Abbau beteiligt ist, kann die Verwendung von Proteasom-Inhibitoren zu einer Anhäufung dieser Proteine führen, wodurch die Funktion von TRIM40 effektiv gehemmt wird. MG132, Lactacystin, Epoxomicin, Bortezomib, Carfilzomib, Ixazomib, Oprozomib, Delanzomib, Marizomib, Nelfinavir, Withaferin A und Celastrol sind allesamt Chemikalien, die das Proteasom hemmen und somit die Aktivität von TRIM40 beeinflussen können. MG132 kann beispielsweise den Abbau ubiquitinierter Proteine verhindern und damit den zellulären Weg, an dem TRIM40 beteiligt ist, unterbrechen, was zu einer Zunahme der Proteine führt, die TRIM40 andernfalls für den Abbau anvisieren könnte. In ähnlicher Weise wirkt Lactacystin auf das Proteasom, um es daran zu hindern, Proteine abzubauen, zu denen auch Substrate von TRIM40 gehören könnten.
Bortezomib und Carfilzomib sind dafür bekannt, dass sie reversibel bzw. irreversibel an das Proteasom binden und so die proteolytische Funktion behindern, die normalerweise den Umsatz der an der Aktivität von TRIM40 beteiligten Proteine regulieren würde. Ixazomib und Oprozomib können durch ihre proteasomhemmende Wirkung zu einer verlängerten Halbwertszeit von Proteinen führen, die TRIM40 für den Abbau markiert. Delanzomib und Marizomib können durch Hemmung des Proteasoms den Abbauweg von Proteinen verändern, die unter dem regulatorischen Einfluss von TRIM40 stehen. Die Hemmung des Proteasoms durch Nelfinavir kann auch zu einer Anhäufung von ubiquitinierten Proteinen führen, was indirekt die Funktion von TRIM40 hemmt. Withaferin A und Celastrol, die die Proteasomaktivität hemmen, können sich in ähnlicher Weise auf den Umsatz von Proteinen auswirken und den Abbauprozess stören, den TRIM40 eigentlich erleichtern soll. Indem sie das Proteasom hemmen, beeinträchtigen diese Chemikalien den Abbauweg des Ubiquitin-Proteasom-Systems und wirken sich auf die Regulierung und Funktion von TRIM40 aus.
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