TMEM31, una proteína transmembrana, tiene su actividad funcional intrincadamente ligada a varias vías de señalización intracelular, y su activación se ve influida por una serie de compuestos químicos que modulan estas vías. Por ejemplo, ciertos compuestos pueden aumentar los niveles intracelulares de AMP cíclico (AMPc), ya sea activando directamente la adenilil ciclasa o impidiendo la degradación del AMPc, promoviendo así la actividad de TMEM31 a través de eventos de fosforilación dependientes de PKA. Además, la actividad de TMEM31 puede ser modulada por alteraciones en los niveles de calcio intracelular. Las sustancias químicas que actúan como ionóforos de calcio o que inhiben la bomba SERCA elevan el calcio citosólico, que a su vez puede activar TMEM31 a través de interacciones con proteínas sensibles al calcio como la calmodulina. Además, la modulación de la actividad de la proteína quinasa C, ya sea por activación directa o por inhibición de sus reguladores negativos, puede conducir a la fosforilación de TMEM31, alterando así su actividad como parte de los procesos de transducción de señales celulares.
Además, algunos compuestos que influyen en el equilibrio iónico dentro de las células, como los inhibidores de la Na+/K+-ATPasa, también pueden contribuir indirectamente a la activación de TMEM31 al inducir cambios que promueven la señalización a través de vías dependientes del calcio. Otros imitan la acción de moléculas de señalización endógenas, como los agonistas beta-adrenérgicos que aumentan los niveles de AMPc, o los análogos del AMPc que activan la PKA, facilitando así la actividad de TMEM31. Además, los activadores de los canales de calcio de tipo L pueden instigar una cascada de acontecimientos intracelulares que, en última instancia, aumentan la actividad funcional de TMEM31.
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