Le sostanze chimiche classificate come inibitori di TMEM231 sono composti che possono influenzare indirettamente le vie funzionali della proteina TMEM231. Poiché TMEM231 è implicata nella struttura e nella funzione delle cilia primarie e nella via di segnalazione Shh, i composti che interrompono queste funzioni possono fungere da inibitori indiretti. Ciclopamina, vismodegib, GANT61, jervine, SANT1, SANT2 e itraconazolo sono esempi di molecole che mirano alla via di Shh in diversi punti; ciclopamina e jervine interferiscono direttamente con componenti come Smoothened o i fattori di trascrizione Gli, mentre vismodegib, SANT1, SANT2 e itraconazolo agiscono come antagonisti di Smoothened, ostacolando l'attivazione della via ed eventualmente influenzando i contributi funzionali di TMEM231.
D'altra parte, composti come forskolina, U18666A, mebendazolo, ciliobrevina A e ciliobrevina D influenzano la struttura e la funzione ciliare. La forskolina, aumentando i livelli di cAMP, può modulare la frequenza e la funzione del battito ciliare, mentre l'U18666A può alterare la composizione della membrana ciliare. Il mebendazolo compromette la stabilità dei microtubuli, influenzando così potenzialmente la ciliogenesi e il mantenimento ciliare dove è coinvolto il TMEM231. Le ciliobrevine A e D inibiscono il traffico ciliare e quindi possono influenzare il ruolo di TMEM231 nell'assemblaggio e nella funzione ciliare.
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