Os inibidores químicos da TMEM106C incluem uma variedade de compostos que perturbam processos e vias celulares específicos para inibir a função da proteína. A floretina, uma dihidrochalcona encontrada nas folhas da macieira, pode inibir a TMEM106C ao interferir com as suas interacções com as bicamadas lipídicas, que são cruciais para a localização e função da proteína dentro da célula. Por outro lado, a genisteína, uma isoflavona encontrada nos produtos de soja, tem como alvo a inibição das tirosina quinases, o que pode levar à redução da fosforilação e subsequente inativação da TMEM106C. O Dynasore, uma pequena molécula que inibe a atividade GTPase da dinamina, pode impedir o tráfico vesicular e a endocitose, processos essenciais para a correcta localização e função do TMEM106C. A brefeldina A, um antibiótico de lactona, perturba a estrutura e a função do aparelho de Golgi, impedindo potencialmente o tráfico e o processamento correctos do TMEM106C.
Além disso, foram identificados vários inibidores de cinase que podem alterar o estado de fosforilação do TMEM106C, inibindo assim a sua atividade. O PD 98059, um inibidor da MEK, pode reduzir a ativação da via MAPK/ERK, que pode ser crucial para a fosforilação e ativação do TMEM106C. O LY294002, um potente inibidor da PI3K, e a Wortmannin, outro inibidor da PI3K, podem diminuir a fosforilação e a subsequente ativação do TMEM106C se este estiver envolvido nas vias de sinalização mediadas pela PI3K. O SB203580, que inibe seletivamente a p38 MAPK, e o Gö 6983, um inibidor da proteína quinase C, podem diminuir a fosforilação do TMEM106C, resultando numa atividade reduzida. A tunicamicina, um antibiótico que bloqueia a glicosilação ligada à N, pode inibir a maturação e a função das glicoproteínas, incluindo a TMEM106C, impedindo a sua correcta dobragem e estabilidade. A tapsigargina, um inibidor da Ca2+ ATPase do retículo sarco/endoplasmático, perturba a homeostase do cálcio, o que pode inibir a TMEM106C se a sua função depender da sinalização do cálcio. Por último, a monensina, um ionóforo que altera o pH intracelular, pode inibir o tráfico e a função do TMEM106C ao perturbar o transporte de proteínas no interior dos organelos celulares. Cada um destes produtos químicos tem como alvo vias e processos celulares específicos que são cruciais para a atividade funcional do TMEM106C, levando à sua inibição.
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