SMARCD2 アクチベーター

一般的なSMARCD2活性化剤としては、トリコスタチンA CAS 58880-19-6、5-アザシチジン CAS 320-67-2、スベロイルアニリドヒドロキサム酸 CAS 149647-78-9、(+/-)-JQ1、モセチノスタット CAS 726169-73-9が挙げられるが、これらに限定されない。

SMARCD2活性化剤は、化学的分類としては、クロマチンの動態に影響を与える化合物の領域、特にヒストン脱アセチル化酵素阻害剤（HDAC阻害剤）とDNAメチル化酵素阻害剤に属する。どちらのカテゴリーもクロマチン環境を変化させることによって作用し、SMARCD2が構成要素であるSWI/SNF複合体を含むクロマチンリモデリング複合体のリクルートまたは機能を促進する。

トリコスタチンA、ボリノスタット、モセチノスタット、バルプロ酸、ロミデプシン、パノビノスタット、ベリノスタット、エンチノスタット、ジビノスタットなどのHDAC阻害剤は、ヒストンの過アセチル化によってクロマチン構造をより弛緩させる。このクロマチン構造の変化は、SWI/SNF複合体、ひいてはSMARCD2がヌクレオソームの再配置や遺伝子発現の調節により積極的に関与する環境をもたらす。一方、5-アザシチジンやデシタビンのようなDNAメチル化酵素阻害剤は、DNAのメチル化レベルを低下させることによって作用する。その結果、クロマチンの脱凝縮が起こり、SWI/SNF複合体がクロマチンリモデリング機能を発揮する道が開かれる。同時に、ブロモドメイン阻害剤JQ1は、BETファミリータンパク質を標的とすることで、ヒストン上のアセチル化リジンの読み取りを阻害し、クロマチンランドスケープを改変する。この変化にはSWI/SNF複合体の関与が必要であり、この複合体におけるSMARCD2の機能的役割が強調される。