RHOT2阻害剤として分類される化合物は、微小管に沿ったミトコンドリアの繋留と輸送に関与するRHOT2タンパク質の機能に影響を与えるものであろう。このような阻害剤はおそらくRHOT2のGTPアーゼ活性、あるいは微小管やモータータンパク質と相互作用する能力を阻害するであろう。しかしながら、ミトコンドリア動態におけるRHOT2の役割の特異性を考えると、直接的な阻害は細胞のエネルギー恒常性とオルガネラの分布に広範な影響を及ぼす可能性がある。
阻害はRHOT2に直接結合し、そのコンフォメーションを変化させ、その結果GTPと結合する能力を変化させるか、あるいはRHOT2の機能に重要な関連タンパク質の調節を通して起こる可能性がある。さらに、微小管トラックの不安定化やRHOT2と相互作用するモータータンパク質の阻害のような、ミトコンドリア輸送系の破壊は間接的にRHOT2の機能に影響を与える可能性がある。RHOT2とミトコンドリア輸送に対するこれらの化合物の正確な影響は、おそらく細胞構造、シグナル伝達経路、ミトコンドリア動態の制御の間の複雑な相互作用に依存するであろう。
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