ラット胸腺細胞、骨髄阻害剤と呼ばれる化学的分類には、ラットの免疫系の胸腺細胞や骨髄内の細胞の生存能力、増殖、分化に間接的に影響を及ぼす多様な化合物が含まれる。これには、免疫抑制剤と細胞傷害剤の両方が含まれ、これらの細胞タイプに抑制効果を及ぼすために、異なるメカニズムで作用する。
シクロスポリンAやラパマイシンなどの免疫抑制剤は、主にT細胞の活性化と増殖に不可欠な重要な経路を阻害することによって作用する。例えば、シクロスポリンAはカルシニューリンのホスファターゼ活性を阻害し、これはインターロイキン-2(IL-2)産生の極めて重要な制御因子である転写因子NFATの活性化に必要である。IL-2はT細胞の増殖に不可欠な成長因子である。一方、ラパマイシンはFKBP12と複合体を形成し、栄養の有無に応じて細胞の成長と増殖を制御する中心的なタンパク質であるラパマイシンのメカニスティックターゲット(mTOR)を標的として、細胞周期の進行に必要な下流のシグナル伝達を阻害する。一方、デキサメタゾン、ブスルファン、5-フルオロウラシルなどの細胞傷害性薬剤がある。これらの化合物は、骨髄に見られるような急速に分裂する細胞に細胞死を引き起こすことがある。グルココルチコイドの一種であるデキサメタゾンは、カスパーゼ酵素の活性化とDNA断片化の誘導により、胸腺細胞を含むリンパ系細胞にアポトーシスを誘導する。ブスルファンと5-フルオロウラシルはDNA損傷により細胞周期停止とアポトーシスを引き起こす。ブスルファンはDNAを架橋することにより、5-フルオロウラシルはDNA合成に必要な酵素であるチミジル酸合成酵素を阻害することにより。
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