Prss34阻害剤は、主にプロテアーゼの活性部位を標的として、その酵素的機能を阻止する多様な化合物群である。例えば、E-64はPrss34の活性部位システイン残基に不可逆的に結合することにより、そのタンパク質分解活性を阻害する。同様に、AEBSFはPrss34の活性部位にあるセリン残基の水酸基をアセチル化することによってPrss34を阻害し、酵素を不活性化する。ガベキサートメシレートとナファモスタットメシレートは、それぞれPrss34の活性部位を占有し、基質へのアクセスを阻害するか、活性部位に可逆的に結合することで機能する。これらの阻害剤の多用途性は、触媒反応を停止させる可逆的結合によってPrss34を標的とするリューペプチンヘミスルフェートによってさらに例示される。もう一つの強力な阻害剤であるアプロチニンは、Prss34と化学量論的複合体を形成し、高度に特異的な方法でその活性を阻害する。
さらに、ある種の阻害剤は、その生化学的環境や基質特異性を利用してPrss34に影響を与える可能性がある。例えば、塩酸ベンズアミジンは基質の遷移状態を模倣し、活性部位でPrss34を競合的に阻害する。トラネキサム酸はその抗線溶作用で一般的に使用されているが、リジン結合部位でPrss34の天然基質と競合し、阻害をもたらす可能性がある。ホスホラミドンはメタロプロテアーゼ阻害剤であるが、タンパク質分解環境と基質へのアクセス性を変化させることにより、間接的にPrss34の機能的活性を低下させる可能性がある。キモスタチンはキモトリプシン様セリンプロテアーゼを阻害することが知られており、酵素の活性部位に強固な複合体を形成することによって、この阻害をPrss34にまで拡大することができる。これらの阻害剤は、そのユニークで特異的なメカニズムにより、Prss34のタンパク質分解活性のダウンレギュレーションに効果的に寄与する。
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