Gli inibitori della Prss34 sono un gruppo eterogeneo di composti che hanno come bersaglio principale il sito attivo della proteasi per impedirne la funzione enzimatica. Ad esempio, E-64 agisce legandosi in modo irreversibile al residuo cisteinico del sito attivo della Prss34, bloccandone così l'attività proteolitica. Analogamente, AEBSF ostacola Prss34 acetilando il gruppo ossidrilico del residuo di serina nel suo sito attivo, rendendo l'enzima inattivo. Gabexato Mesilato e Nafamostat Mesilato funzionano occupando il sito attivo di Prss34, impedendo l'accesso al substrato o legandosi reversibilmente al sito, rispettivamente. La versatilità di questi inibitori è ulteriormente esemplificata dalla leupeptina emisolfato, che colpisce Prss34 attraverso un legame reversibile che blocca la catalisi. L'aprotinina, un altro potente inibitore, forma un complesso stechiometrico con Prss34, inibendo così la sua attività in modo altamente specifico.
Inoltre, alcuni inibitori possono influenzare Prss34 sfruttando il suo ambiente biochimico o la specificità del substrato. La benzamidina HCl, ad esempio, imita lo stato di transizione dei substrati per inibire competitivamente Prss34 nel suo sito attivo. Anche l'acido tranexamico, sebbene comunemente utilizzato per le sue proprietà antifibrinolitiche, potrebbe competere con i substrati naturali di Prss34 nei siti di legame della lisina, con conseguente inibizione. Il fosforamidone, pur essendo un inibitore della metalloproteasi, potrebbe indirettamente diminuire l'attività funzionale della Prss34 modificando l'ambiente proteolitico e l'accessibilità del substrato. La chimostatina è nota per inibire le serin-proteasi simili alla chimotripsina e può estendere questa inibizione alla Prss34 formando un complesso stretto nel sito attivo dell'enzima. Questi inibitori, attraverso i loro meccanismi unici e specifici, contribuiscono efficacemente alla riduzione dell'attività proteolitica della Prss34.
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