Os inibidores químicos da Pex7p utilizam várias vias bioquímicas para impedir a sua função. A triacsina C tem como alvo a acil-CoA sintetase de cadeia longa, essencial para a produção de acil-CoA, reduzindo assim a disponibilidade de substratos para o metabolismo peroxissomal e afectando indiretamente a atividade da Pex7p. A perhexilina restringe o sistema carnitina palmitoiltransferase, que transporta os ácidos gordos de cadeia longa para a mitocôndria, levando a uma acumulação intracelular destes ácidos gordos que pode perturbar os processos peroxissomais que envolvem a Pex7p. Do mesmo modo, a tioridazina impede a absorção de ácidos gordos de cadeia longa nos peroxissomas, alterando potencialmente a composição da matriz e afectando o funcionamento ótimo da maquinaria de importação de Pex7p. O ácido ginkgólico, por outro lado, dificulta o processo de SUMOilação. Esta modificação pós-traducional é vital para numerosas proteínas e, se esta modificação for crucial para a Pex7p ou para as suas proteínas de carga, a inibição pelo ácido ginkgólico pode afetar o papel da Pex7p na importação de proteínas para os peroxissomas.
O Ebselen e o Ácido Tetradeciltioacético exercem a sua influência modulando as respostas ao stress oxidativo e as vias de β-oxidação, respetivamente, o que pode levar a alterações no ambiente peroxissomal, afectando potencialmente a funcionalidade da Pex7p. Os agonistas do PPAR, incluindo o Clofibrato, o Fenofibrato e o Bezafibrato, promovem a proliferação dos peroxissomas. Este aumento da biogénese peroxissomal pode levar a uma sobrecarga da capacidade de importação do organelo, resultando numa acumulação que impede a capacidade da Pex7p de facilitar a importação de proteínas para os peroxissomas. A lovastatina, ao inibir a síntese de colesterol, pode alterar as propriedades da membrana peroxisomal, comprometendo potencialmente a interação da Pex7p com a membrana peroxisomal e os complexos de importação associados. Por último, a leptomicina B, embora seja principalmente um inibidor da exportação nuclear, pode influenciar indiretamente a Pex7p ao afetar a distribuição celular e os níveis dos factores de transcrição, que são vitais para a expressão das proteínas peroxissomais, afectando assim a capacidade funcional da Pex7p no peroxissoma.
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