カルボニルシアニド m-クロロフェニルヒドラゾンは、OTOP2が属するプロトン選択性イオンチャネルの制御において重要な因子である。ZnCl2は、イオンチャネルにしばしば存在する潜在的な金属結合ドメインとの相互作用を通じて、間接的にOTOP2を調節する可能性がある。この調節は、構造の変化やOTOP2を取り巻くイオン環境の変化の結果である可能性がある。これと並行して、上皮性ナトリウムチャネルを遮断することで知られるアミロリド、ベンズアミル、およびそれらの誘導体などのナトリウム輸送阻害剤が、ナトリウムのホメオスタシスが変化する細胞内状況を作り出し、pHバランスを維持するためにOTOP2の関与が必要となる可能性がある。
ベラパミルのようなカルシウムチャネル拮抗薬は、他のタイプのイオンチャネルを遮断するために使用されるガドリニウム化合物とともに、プロトン輸送とは直接関係しない細胞内のイオンホメオスタシスに変化をもたらすが、その結果生じる調節異常を修正するためにOTOP2の作用が必要となる可能性がある。古典的なNa+/K+ ATPase阻害剤であるオワバインや、ニフルミン酸やIDRA 21などのクロライドチャネル遮断剤は、イオンとpHの微妙なバランスを乱し、OTOP2の調節活性が不可欠となるシナリオを作り出す。特異的なV-ATPアーゼ阻害剤であるバフィロマイシンA1は、細胞内プロトン濃度に影響を与えるより直接的なアプローチの例であり、細胞が乱れに対抗しようとしてOTOP2の活性化につながる事象のカスケードを引き起こす可能性がある。カリポライドと5-(N-エチル-N-イソプロピル)-アミロライドは、どちらもNa+/H+交換体の阻害剤であるが、これらの作用によって細胞内のpHレベルが変化し、細胞の恒常性反応の一部としてOTOP2が補正するよう促す可能性があることから、OTOP2の活性におけるpH調節の重要性が強調されている。
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