NMNAT-3活性化剤には、主にミトコンドリア機能とNAD+生合成に影響を与える化合物が含まれる。このクラスは、ニコチンアミドリボシド、ニコチンアミド、ニコチン酸などのNAD+生合成の前駆体やエンハンサーによって占められている。これらの化合物は、NMNAT-3が重要な酵素であるNAD+産生につながる経路に直接関与している。NAD+の生合成を促進することで、NMNAT-3の活性をアップレギュレートしたり、基質の利用性を高めたりする可能性がある。このクラスのもう一つの重要な部分は、ミトコンドリア機能とエネルギー代謝を調節する化合物で構成されている。レスベラトロール、プテロスチルベン、ケルセチン、コエンザイムQ10などがその例である。これらはミトコンドリアの生合成、効率、全体的なエネルギー産生に影響を与え、その過程はNAD+代謝やNMNAT-3活性と密接に関連している。
メトホルミンとベルベリンは、代謝調節における役割のために含まれている。広く使用されている抗糖尿病薬であるメトホルミンと植物由来のアルカロイドであるベルベリンは、どちらも代謝経路とミトコンドリア機能に影響を与え、それによってNMNAT-3活性に影響を与える可能性がある。さらに、このクラスにはサーチュイン活性化物質や、チアミン(ビタミンB1)やα-リポ酸のような必須栄養素も含まれる。サーチュインは、その活性をNAD+に依存するタンパク質ファミリーであり、老化やストレス応答を含む様々な細胞プロセスに関与している。サーチュインの活性化は、NAD+代謝を変化させることにより、間接的にNMNAT-3に影響を与える可能性がある。チアミンとα-リポ酸はミトコンドリアのエネルギー代謝に不可欠であるため、NMNAT-3の活性に影響を与える可能性がある。
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