NHE-6の化学的活性化剤は、様々な細胞メカニズムを通してその機能を増強することができる。主にNa+/H+交換体の阻害剤として知られているEIPAは、交換体の他のアイソフォームを阻害することによって間接的にNHE-6の活性を増加させることができ、細胞内のイオンバランスを維持するためにNHE-6活性の代償的なアップレギュレーションを引き起こす可能性がある。亜鉛は、アロステリックモジュレーターとして、NHE-6の特定の部位に結合し、トランスポーター活性を高める構造変化を誘導することができる。同様に、スペルミンやスペルミジンのようなポリアミンは、ポリアミン結合部位でNHE-6と相互作用する可能性があり、その活性を上昇させる可能性がある。フォルスコリンは、細胞内cAMPレベルを上昇させることにより、プロテインキナーゼA(PKA)を活性化し、PKAの基質範囲内であればNHE-6をリン酸化し、活性を増加させる可能性がある。IBMXはホスホジエステラーゼを阻害することによりcAMPレベルを上昇させ、同様にPKAを活性化し、NHE-6をリン酸化する可能性がある。
cAMPアナログであるジブチリル-cAMPは、PKAを直接活性化し、NHE-6をリン酸化して活性化する可能性がある。PMAのようなホルボールエステルはプロテインキナーゼC(PKC)を活性化し、NHE-6がPKCの基質であれば、NHE-6もリン酸化される可能性がある。イオノマイシンやA23187のようなカルシウムイオノフォアは細胞内カルシウムレベルを上昇させ、カルモジュリン依存性キナーゼを活性化する可能性がある。これらのキナーゼはNHE-6を標的とし、リン酸化による活性化につながる可能性がある。カリクリンAとオカダ酸はタンパク質リン酸化酵素の阻害剤として、タンパク質の脱リン酸化を防ぐ。NHE-6がリン酸化によって制御されているならば、これらのリン酸化酵素の阻害は、リン酸化レベルの増加によるNHE-6の持続的な活性化をもたらすであろう。これらの化学物質はそれぞれ、細胞の生化学的経路を調節することによってNHE-6の活性に影響を与え、NHE-6が機能的に活性であることを保証することができる。
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