Gli inibitori della NELF costituiscono una classe eterogenea di composti che modulano l'attività della NELF, un regolatore chiave della pausa dell'RNA polimerasi II (Pol II). Questi inibitori possono essere classificati in inibitori diretti e indiretti in base al loro meccanismo d'azione. Gli inibitori diretti, come il triptolide, il flavopiridolo, il DRB e il THZ1, agiscono prendendo di mira i componenti del complesso del fattore di allungamento positivo della trascrizione b (P-TEFb), in particolare CDK9. Il triptolide, ad esempio, interrompe la pausa della RNA polimerasi II legandosi alla subunità catalitica di P-TEFb, liberando Pol II dalla pausa prossimale del promotore e promuovendo l'allungamento trascrizionale. Analogamente, il flavopiridolo inibisce la NELF bloccando l'attività di CDK9, impedendo la fosforilazione di Pol II e favorendo l'allungamento trascrizionale.
Gli inibitori indiretti, come l'actinomicina D, l'alfa-amenitina, il JQ1 e il C646, esercitano i loro effetti influenzando vari processi cellulari legati alla trascrizione. L'actinomicina D e l'alfa-amanitina interrompono l'iniziazione della trascrizione legandosi al DNA o all'RNA polimerasi II, rispettivamente, determinando una riduzione del reclutamento di Pol II e impedendo la pausa mediata da NELF. JQ1, invece, inibisce indirettamente NELF prendendo di mira BRD4, interrompendo la formazione del Super Elongation Complex (SEC) e impedendo il reclutamento di SEC nella cromatina. Infine, il C646 inibisce indirettamente la NELF prendendo di mira l'attività dell'istone acetiltransferasi (HAT) di p300/CBP, alterando l'accessibilità alla cromatina e riducendo la formazione di complessi di pausa sui geni bersaglio. Inoltre, composti come la camptoteina e l'I-BET151 dimostrano un'inibizione indiretta attraverso le vie di risposta al danno al DNA o l'interruzione della formazione di SEC, rispettivamente, influenzando la pausa mediata da NELF. In sintesi, la classe chimica degli inibitori di NELF comprende una serie di composti con meccanismi d'azione distinti, che modulano direttamente o indirettamente le dinamiche di pausa e allungamento della RNA polimerasi II. La comprensione dell'intricata rete di regolazione che coinvolge NELF e i suoi inibitori fornisce preziose indicazioni sulle potenziali strategie per le condizioni in cui è implicata la disregolazione trascrizionale.
| Nome del prodotto | CAS # | Codice del prodotto | Quantità | Prezzo | CITAZIONI | Valutazione |
|---|---|---|---|---|---|---|
Triptolide | 38748-32-2 | sc-200122 sc-200122A | 1 mg 5 mg | $88.00 $200.00 | 13 | |
Il triptolide inibisce direttamente NELF interrompendo la pausa della RNA polimerasi II (Pol II). Si lega alla subunità catalitica del complesso P-TEFb, liberando Pol II dalla pausa prossimale del promotore. Questa inibizione diretta consente un maggiore allungamento trascrizionale e impedisce la pausa di Pol II mediata da NELF. | ||||||
Flavopiridol | 146426-40-6 | sc-202157 sc-202157A | 5 mg 25 mg | $78.00 $254.00 | 41 | |
Il flavopiridolo inibisce la NELF in modo diretto, prendendo di mira la CDK9 all'interno del complesso P-TEFb. Bloccando l'attività di CDK9, il flavopiridolo impedisce la fosforilazione di Pol II e inibisce la pausa mediata da NELF. Questa inibizione diretta promuove un allungamento trascrizionale efficiente facilitando il rilascio di Pol II dai complessi in pausa. | ||||||
DRB | 53-85-0 | sc-200581 sc-200581A sc-200581B sc-200581C | 10 mg 50 mg 100 mg 250 mg | $42.00 $185.00 $310.00 $650.00 | 6 | |
DRB inibisce direttamente NELF interferendo con la funzione di CDK9 nel complesso P-TEFb. Attraverso l'inibizione di CDK9, DRB interrompe la fosforilazione di Pol II e impedisce la pausa mediata da NELF. Questa inibizione diretta promuove la transizione da Pol II in pausa a Pol II in allungamento, facilitando l'attività trascrizionale. | ||||||
THZ1 | 1604810-83-4 | sc-507542 | 1 mg | $95.00 | ||
Il THZ1 inibisce direttamente NELF prendendo di mira CDK7, un componente del complesso P-TEFb. Inibendo CDK7, THZ1 interrompe la fosforilazione di Pol II e impedisce la pausa mediata da NELF. Questa inibizione diretta facilita il rilascio di Pol II dalle regioni prossimali del promotore, promuovendo l'allungamento trascrizionale e prevenendo la pausa. | ||||||
Actinomycin D | 50-76-0 | sc-200906 sc-200906A sc-200906B sc-200906C sc-200906D | 5 mg 25 mg 100 mg 1 g 10 g | $73.00 $238.00 $717.00 $2522.00 $21420.00 | 53 | |
L'actinomicina D inibisce la NELF indirettamente, intercalandosi nel DNA e impedendo l'inizio della trascrizione. Legandosi al modello di DNA, l'actinomicina D ostacola l'assemblaggio del macchinario trascrizionale, riducendo il reclutamento di Pol II. Questa inibizione indiretta impedisce la pausa mediata da NELF limitando l'inizio della trascrizione. | ||||||
α-Amanitin | 23109-05-9 | sc-202440 sc-202440A | 1 mg 5 mg | $260.00 $1029.00 | 26 | |
L'alfa-amenitina inibisce NELF indirettamente inibendo selettivamente la RNA polimerasi II (Pol II) durante l'allungamento della trascrizione. Legandosi all'enzima Pol II, l'alfa-amanitina arresta il processo di allungamento, impedendo la pausa mediata da NELF. Questa inibizione indiretta altera il normale ciclo trascrizionale, portando a una diminuzione delle pause e a un aumento dell'allungamento. | ||||||
(±)-JQ1 | 1268524-69-1 | sc-472932 sc-472932A | 5 mg 25 mg | $226.00 $846.00 | 1 | |
Il JQ1 inibisce la NELF in modo indiretto, prendendo di mira BRD4 e interrompendo la formazione del Super Complesso di Allungamento (SEC). Inibendo BRD4, JQ1 impedisce il reclutamento di SEC nella cromatina, inibendo la pausa mediata da NELF. Questa inibizione indiretta promuove l'allungamento trascrizionale impedendo la formazione di complessi di pausa sui geni bersaglio. | ||||||
Camptothecin | 7689-03-4 | sc-200871 sc-200871A sc-200871B | 50 mg 250 mg 100 mg | $57.00 $182.00 $92.00 | 21 | |
La camptoteina inibisce NELF indirettamente inducendo un danno al DNA e attivando le vie di risposta al danno al DNA. L'attivazione di queste vie porta all'inibizione dell'iniziazione della trascrizione, impedendo la pausa mediata da NELF. Questa inibizione indiretta altera il normale ciclo trascrizionale, riducendo la formazione di complessi di pausa sui geni bersaglio. | ||||||
C646 | 328968-36-1 | sc-364452 sc-364452A | 10 mg 50 mg | $260.00 $925.00 | 5 | |
Il C646 inibisce la NELF in modo indiretto, colpendo l'attività dell'istone acetiltransferasi (HAT) di p300/CBP. Inibendo p300/CBP, il C646 altera l'accessibilità alla cromatina, impedendo la pausa mediata da NELF. Questa inibizione indiretta promuove l'allungamento trascrizionale influenzando il paesaggio epigenetico e riducendo la formazione di complessi di pausa sui geni bersaglio. | ||||||
I-BET 151 Hydrochloride | 1300031-49-5 (non HCl Salt) | sc-391115 | 10 mg | $450.00 | 2 | |
I-BET151 inibisce NELF in modo indiretto, prendendo di mira BRD4 e interrompendo la formazione del Super Complesso di Allungamento (SEC). Inibendo BRD4, I-BET151 impedisce il reclutamento di SEC nella cromatina, inibendo la pausa mediata da NELF. Questa inibizione indiretta promuove l'allungamento trascrizionale impedendo la formazione di complessi di pausa sui geni bersaglio. | ||||||