A TMEM66, coloquialmente designada por SARAF, desempenha um papel intrincado nos processos celulares, com particular ênfase na sinalização do cálcio. A complexa interação desta proteína no meio celular permite que várias entidades químicas modulem a sua função, quer direta quer indiretamente. Por exemplo, substâncias químicas como a forskolina, que aumenta os níveis intracelulares de AMPc, e o cloreto de lítio, que modula a sinalização Wnt, criam um ambiente celular em que o funcionamento da TMEM66 é afetado. Além disso, dada a importância do cálcio no funcionamento do TMEM66, substâncias químicas como a tapsigargina, a ionomicina, a ryanodina e o A23187, que influenciam os níveis de cálcio intracelular, constituem potenciais vias de modulação do TMEM66.
O U0126, com o seu efeito na sinalização MAPK, e a influência do LY294002 na via PI3K/AKT, realçam a importância destas vias de sinalização na funcionalidade do TMEM66. Além disso, o papel da ativação da proteína quinase C (PKC) por PMA e a influência da rapamicina nas vias mTOR sublinham o nexo de sinalização abrangente associado ao TMEM66. A profunda ligação do TMEM66 com a sinalização de cálcio é ainda exemplificada pelo BAPTA-AM, um quelante de cálcio, ilustrando como as alterações na homeostase do cálcio podem desempenhar um papel significativo nos processos do TMEM66.
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