L'EGCG e la genisteina sono composti che interagiscono con le chinasi, enzimi che aggiungono gruppi fosfato alle proteine, una modifica che può cambiare l'attività, la localizzazione e la funzione di una proteina. Inibendo queste chinasi, questi composti possono impedire la disattivazione di proteine o provocare l'attivazione di altre come parte di un ciclo di feedback. Al contrario, il fluoruro di sodio e l'acido okadaico agiscono come inibitori della fosfatasi, impedendo la rimozione dei gruppi fosfato dalle proteine, mantenendo o migliorando il loro stato di attivazione.
La curcumina e il resveratrolo sono composti che modulano le vie di segnalazione influenzando i fattori di trascrizione e le sirtuine, rispettivamente, influenzando l'espressione e la modificazione post-traduzionale delle proteine. La staurosporina e la bisindolilmaleimide I, pur inibendo ampiamente le protein chinasi, evocano risposte di segnalazione complesse che possono portare all'upregulation di vie alternative, influenzando così l'attività delle proteine. L'anisomicina e la capasaicina dimostrano come l'inibizione della sintesi proteica e l'attivazione di vie mediate da recettori possano innescare una cascata di eventi che portano all'attivazione di elementi di risposta allo stress e di proteine sensoriali. PD98059 e H-89 evidenziano l'intricata rete di segnalazione cellulare in cui l'inibizione di un enzima, come MEK o PKA, può attivare proteine all'interno di altre vie come parte dello sforzo della cellula di mantenere l'equilibrio.
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